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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_01275



RNA: CRW_01275
Rfam family: -

CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAUGCGCUUGUCUUGAAGAUUUAGCCAUGCAAGCUAGCGAAGCCUUAUGGUGGAGCGGCGGACAGCUCAGUAAUACAGUUAUUAUUUACUCGUAGUAUGUAUACGGAUAACCAUGGUAAGCUAUGGCUAAUACGUGAACAGGUUAUUGCAUAGAUGAAACAGCGAUAACUGAGAGAGCAAUCGACUACGACUAAGUUUCUGGCCUAUCAGCUAGAUGGUAAGGUAAUGGCUUACCAUGGCUAUAACGGGUAACGGGAAAUCAGUGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUUCCUUAGCGGGAGAGGUAGUGAAGAGACAUGAAGUUCUACUUAGAGACUGUACGGUAAAAUAGUACAGGAUCUACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGCGCAUAUAAUAGUUGCUGCAGUUAAAACGUCCGUAGUUGAUCACAAGGUAUUCUUCUGCAUAGUAUUUGUGGAGUGUAUCUCGAUACUGUGAGAAAAAUAUGGUUCUCAAAGCGGAUUACGUGAGUAAUUUAGCAUGGGACAUGGUGAAUAUAGGAACAGAUGAUGGCAAUAGUAUUCAGCAGUUAGAGGUGAAAAUCGUUGACCUGCUGAGGACUCUCUGAAGCGAAAGCGAUUGUCAAGUAUGUCUCCGUUAAUAAAGGACUUAAGCUGGAGUAUCGAAGAUGAUUAGAUACCGUCGUAGUUCCAGCUGUAAACUAUGCCGACUAGGUGAGGCCGUCAGGCUGCGCCUUAGGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGCUCUGGGGAUAGUAUGGAUGCAAAUCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCAGGGCCGAAUGCAUAGGAGAUCGGCUGUCUGAGAGGGUACCCGAGAUUAUGCAGGAGGUGGUGCAUGGCCGUUUUCAACACGUGGGGUGGCCUGUCUGGUUAAUUCCGUAAACGCGUGAGGCCUGGGAAGCAAUUCAUUGCUUGACGGAUAGCGGCAAGCUAUAGGAAGACAGGCUAUAACAGGUCAGUGAUGCCCCUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUGGUAUAGUGAGACUAUGUACUGAAAAGUAUGCUUUAAGCUAUAUCGAAUCUGGGAUAAGCUCUUGUAAAUGAGUUUUGAACGAGGAAUUCCUAGUAAUCGCAGGUCAUAAUGCUGCGAUGAAUGCGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCACUAUCUUAGAUGGAUGUAUCGGUGAAAUGGCUGGACGAAAGAAAGGCAGUUGAACCUAUACAAUUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAAGGCUGCUAUAGGUGAACCUGUGGCAGGAUCAUUA
Reference structure (ext) [ sec struct ] ...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((.....((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((((............)))))))))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((...)))).....((((((.........))))))......(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.((((......................((((((.............(((.((((..........(((.....)))...)))))))..........))))))...)))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((....))))))))))...{{..))}}...}}}....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((......((((((((((....))))))))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((....))))))..((((((((.....))))))))...))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.........(((((....)))))........)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (...(((((.(..((((((...(((((.(((.(((.....)))..))))))))..((((((...(((....)))..(((((.((((.((.......(((.........((((((((.(((....)))..(((.((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))....((....))...))))........((((((......))))))......))).)))))))))))))).))).)))))))).(((((.((..(((((.((((((((..((((((..........))))))..((((.....((((.((.(((((...(((.(((...((((.....))))..))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).)))).....(((((((((.(((((((..........)))))))..........((((...(((((((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..(((((((((....))))))).)).)))))....)))).....((((((.((..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))........((....)).))))))).)).))).))).)))))...))))...)))))))))..................((((((..(((((((((((...(((.(((..(((((((.((((....)))).)))).)))((....))..........)))..)))..))))).)))).))...(((.........)))...))))))..)))).((((.....))))...((((((((((....((..((.(..((((((.....((((.((((..(((((((....((((.(..((....))..).))))..))))))).....)))).).)))......(((..((.((..(((((((((((.......(((.......(((.((((....(((....)))...)))).))).(((((.....))))).))))))))))))))..)).))...)))))))))..).)).))))))))))))...........(((((((((........(((((....))))).......)))))))))..))))))))((((((........)))))).)))))..)).))))).)))(((((((.........)))))))....))))))))))).........(((((.(((((.........)))))......))))).....))))).).......)))))).).))))).........(((..(((....))).........((((((((((....)))))))))).)))...)
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((.((((.(((......(((((((...((((((..((((((.(((..(((..((((((((((((.((((((((..((((.((((((....))))))...(((......(((..(((.((..((((((....))))))...)).)))..)))(((((((((............)))))))))))).)))).....((((((((....((((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....))))..))))))....(((((((((((((((..((((((..........))))))...)))..)))((((....(((((...(((.(((...(((((....))))).))))))....((((.....(((((.((((((..((((((.........))))))..))))..)))))))..)))).)))))....))))(((((.((((((((...((((((...........)))))).........((((...((...((((...(((((..(((.(((((((((...............))))))))))))..))))).(((((....(((((((((....))))))).))..)))))...))))..)).((((((.....((((((((((..(((((((...((...........))...)))))))..))).......((....)).)))))))....))).))).........))))...)))))))))))))......))))))))).))))))))))).)))))........)).))))..)))))))))...)))..((((....((((((....))))))))))..........))))))....))))))....((..((((...((((((..((.....(((((((..(((..(((((((((.....(((((.....(((((((((.(((...((((..(((((((....((((...(((....)))...))))..))))))).....))))..((((((((((((..((((((((((((((.....)))))..))).....))))))....(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))..)))))).))))))....))).)))..))))))..)).)))..))))))))).((((......(((((((((........(((((....))))).......)))))))))...((((((.....((((((.............))))))...))))))..(((((((.........)))))))...)))))))....))))))).....))..))))))...))))....)).((((..(((..(((.(((............))).)))..)))..))))...)))))))........)))....)))).((((((((....)))))))).))))))...
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......))))).......................................................((((........))))..((((......))))..((((((((.......)....(((.((((((((((((((.(((............(((((((((............)))))))))...........................((((((......))))))......))).)))))))))))))).))).))))))).......(((.......)))(((((((.((((((..........)))))).).)))..)))((((.((.(((((...((((.(((..(((((....))))).(((((.................)))))((((..((((((.........))))))..)))).....))).))))...))))).)).))))............(..(((((((..........)))))))..)...........................((((.((((.(((((((((...............))))))))))))).))))....(((((..(((((((((....))))))).)).)))))........................((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))).......((....)).)))))))...........................((((((((((((...........))).........)))))))))..............(((((((.((((....)))).))))).))...................................((((....))))...............((((((..((.....((((((((((....(((((((((.........((.(..(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))...........................(((((((((((...........................(..((((((....))))))..)..(((((.....)))))....)))))))))))....))).)))..))))))..).))....))))))))).(((.......(((((((((.......((((((....))))))......)))))))))...((((((.((((((........))))))............))))))..(((((((.........)))))))....)))....)))))))))).....))..)))))).(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..)))))))...............((((((((((....))))))))))........
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......)))))..(((((((...(((((...(.....(((.(((..(((.((...(((....)))...)))))......(((.......(((..(...((...(((((((.(((.((((.....(((((......)))))......)))).)))(((((((((............)))))))))....((....)).)))))))..)).)..))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).)...(((.(((...(((((....))))).))))))...)))))...................((((((.........))))))...(((((((((.......((((.....((....)).......)))))))))))))))))))).(((((...............((((...((((((.....(((((..(((((((.......))))))).))))).........((((((........))))))..((...((((....))))....))..((((((((.(.........................((..((((((((...((........))......))))))))..)).......((....))........).)))))))).))))))...))))...(((((((....(...((((.........))))...).)))))))....)))))((((((..((((.((((....)))).))))....((....))...)))....)))...(((........((((....))))....)))........(((((.(((((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))..(((.((((..(((((((((((.......)))...((((((((......((((..................))))((((....))))....(..(((((.....)))))..).))))))))...))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))).)...((((((((........(((((....))))).......))))))))...(.((....((((((........))))))....)).)..))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))....(..((.(..(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))...).))...)....((((((((((....))))))))))........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......)))))..........................(((((....(((.....)))...)))))...((.((((((......((((((....))))))((((((((.(((....)))..(((.((((((((((((((.(((..(((((...(.(((((((((............)))))))))).....))....((((.......))))((((((......))))))..))).))).)))))))))))))).))).))))))))......((((.....))))(((((((.((((((..........)))))).).)))..)))((((.((.(((((.(.((((.(((..(((((....))))).(((((.................)))))((((..((((((.........))))))..)))).....))).)))).).))))).)).)))).((.....)).(((.(((((((..........))))))).)))......)))))).))..........(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))(..(((((..(((((((((....))))))).)).))))))............((((((.....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))).......((....)).)))))))....))).)))....(...........((((((((((((...........))).........))))))))).....(....(...(((((((.((((....)))).))))).)))..........).......................((((....))))..............)((((((..((.....(((((((((((...((((((((((........((.(..(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))(((.....)))(.........)..(..(((((((((((.......(((((....)))......(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))..)))))))))))))..).))).)))..))))))..).))...))))))))))(((((......(((((((((.......((((((....))))))......)))))))))...((((((.((((((.(....).))))))..........()))))))..(((((((.........)))))))...)))))..))))))))))).....))..)))))).(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..)))))))...............((((((((((....))))))))))........
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...[[[.)))))..(((((.(((.((((...))))..))))))))........]]](((........[[[[))).....]]]](((((((....)))))))(((.[[[[)))....]]]].....((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))...............))))((((....((((((......))))))))))..))).))))))))))))))......(((....(((((..((((...)))))))))....[[[[[[))).......]]]]]]..(((....)))((((.(((((........((((...((((.....))))..))))(((......)))...(((((...((((..((((((.........))))))..))))....)))))..))))).)))).(((((...((((.((((((((...((((((...........)))))).........((((........((((...(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).)))))...(((((....(((((((....)))))))....)))))....)))).....((((((.....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).)))................)))))))....))).))).........))))...))))))))))))...((((.........)))).........)))))..((((((((....(((((.((((....)))).)))))....((((((....)))))).)))..[[[[.)))))..((((....))))....]]]].............(((....((((.....))))......[[[[[[...(((.(((......)))))))))....]]]]]]..(((((((....((((.((((......)))).))))..)))))))(((..((((.[[[[))))..)))....]]]]..(((((((((((......((((((....))).)))(((....((((((....)))))).....[[[[[)))..]]]]]....))))))))))).....(((.(((.(((.((((((...))))))..)))))).........[[[[[[[[[..)))..((((((....))))))......]]]]]]]]]...((((((.((((((........))))))...[[[[[[[[[))))))..(((((((.........)))))))............]]]]]]]]]...(((((..[[[[.(((((...)))))......))))).........]]]]......(((.[[[[[..)))...]]]]].(((..[[[....))).........((((((((((....)))))))))).]]]....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((..((.((((.((..((((((..((((((.((((((..((((.(((.(((....))).((((........)))).((((((....))))))....))))))).(((.((((..((.((((((....)))))).))...)))).)))(((((((((............)))))))))..((((((.((((((((((((.....(((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....))))..))))).((((.....))))((((((..((((((.((.....))))))))...)))..)))((((.((.(((((...(((.(((...(((((....))))).))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).)))).((.....)).(((.(((((((..........))))))).)))......)).))))))))))......(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).))))).)))))).....(((((((....))))))).))))))(((.(((((..(((((((((((..((((.(.(((((.((((((((((((.(((....))).)))).))))))))(((..((....((....))))..)))......((((((((((((..........((((((((...(((..((......))....)))...))))))))....(((((.((..(((((((.((((....)))).)))).))).(((..(((((...)))))..))).)).))))).(((((....)))))............)))))))))..))).((((.....))))...((((((((((....((..((....(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...))).((..((((((((((((..((((((((((((((.....)))))..))).....))))))....(((..((((((....))))))..))).((((.....))))...)))))).)))))).)).))).)))..))))))....)).)))))))))))).(((.((((....)))).)))..))))).((((....)))).(((...)))..((((........)))).((((........)))).....((.(((....))).)).(((((((.........)))))))....))))).)))))).)))))..)))))...)))...((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))).))))))....)))))).)))))).))........))))))))))...
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.dddddd)))))............................................(((..................................................................((((((((((((((.((.............(((((((((............)))))))))....((....))................(((((......)))))........)).))))))))))))))....................((.......)).........((((((..........))))))...(((((((((((((.(((((........((((....((((....))))..))))...............(((((...((((..((((((.........))))))..))))..bb)))))..))))).))))....................((BB((((((..........))))))..)).........................(((([[.[[((((({{{{{{{)))))....))))..}}}}}}}....]].]].......((((..(((((((((....))))))).)).))))...............ccccc......(((((..((.((((((((((...(((....)))...)).)))))))).))........((....))..)))))............................((((((((...(((................)))...))))))))................(((((.((((....)))).)))))...((....))...)))))))))................(((....)))................................................((...................((((((..........(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))............................((((((((((...............eeeeee..eeeeee.............(((((.....<<....)))))>>.....))))))))))..............))))))........EEEEEE))EEEEEE.........((((((((.......((((((....))))))......))))))))....((((((....((aaaaa.....))......AAAAA....))))))..(((((((.........)))))))...........CCCCC.....................(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..))))))).............))).((((((((....))))))))DDDDDD....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((....(((((.(((.((((...))))..))))))))..(((..(...(((....))).((((........)))).((((((....))))))......).)))..((.((((.....((((((....))))))......)))).)).(((((((((............)))))))))..((((((.((((((((((((.......(((((......))))).(((((((.......)))))))................(.(((.((((.....))))))))....((((((.((.....)))))))).((((....))))((.((.(((((...((.((((...(((((....))))).))))))....((((.......(((...((((..((((((.........))))))..))))..)))......)))).))))).)).))...((.....)).(((.(((((((..........))))))).)))......)).))))))))))......(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).))))).))))))...((.((((((....))))))..)).((((...(((((..(((((((((((....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))).......((....)).))))))).....((((((((((((..........((((((((...(((................)))...))))))))....(((((.((..(((((((.((((....)))).))))).)).(((..(((((...)))))..))).)).)))))..((((....)))).............)))))))))..))).((((.....))))...((((((((((....(.........(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...))).((.....))..............(..(((((((((((.........(........)......(((..(((((......)))))..)))(((((.....)))))....)))))))))))..).))).)))..)))))).......).)))))))))).((((.......((((((((........(((((....))))).......))))))))....((((((....(((.....(.......).....)))....))))))..(((((((.........)))))))...))))...))))))).))))..)))))))))....(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))..((((.......))))...(((((....)))))))))))))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......))))).....(((((((((..........((((((((.((((((.....(((((((....((((........))))...............(((((.(((((((..((.((((..((.((((((....)))))).))...)))).)).(((((((((............)))))))))....((....)).))))))).))))).((((((......))))))..)))))))..))))))..))))))))....[[[[[[(((((..((((...)))))))))....((((((..........)))))).((((....))))...)))))))))....]]]]]]....((((.(((((...(((.(((..((((((((..(((((...((((..((((((.........))))))..))))....)))))..(((((...((..((((..(((.......((((.(((((((..........))))))).)))).......)))..)))).((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..(((((((((....))))))).)).)))))....)))).....))..)))))..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).))))).))))))).))........((....)).)))))))..)))))))).....(((((((((...((((((((...(((..((......))....)))...))))))))....(((((.((....(((((.((((....)))).)))))..((((...((((.....)))).)))).)).)))))..(((((((..................((((.((........((((.....))))...((((((((((....(((.......(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...))).((..((((((((((((..((((((((.(((((.....)))))...)).....))))))....(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))..)))))).)))))).)).))).)))..)))))).....))).)))))))))).))))))....(((((((((........(((((....))))).......)))))))))...((((((.((((((........))))))............))))))..(((((((.........)))))))...)))))))..))))))))).)))))).)))))...(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))...........))))((((((((((....))))))))))........
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((....(((((.(((.((((...))))..))))))))..(((.((((.(((....))).((((........))))(((((((....)))))))...))))))).(((.((((.(((.((((((....)))))).)).).)))).)))(((((((((............)))))))))..((((((.((((((((((((...(((((((((..<<.<))))))(((((((.......)))))))....>>>.........(.(((.(((((...)))))))))....((((((.((.....)))))))).((((....))))......(((((...((.((((...(((((....))))).)))))).....................((((..((((((.........))))))..))))................)))))...................(((.(((((((..........))))))).)))...))))).))))))))))......(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).))))).))))))...(((((((((....))))))).))(((((...(((((..(((((((((((....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).)))................)))))))....(((((((((((((.......(((((((((((((.(((................))))).)))))))).)))(((((.....(((((((.((((....)))).))))).)).(((..(((((...)))))..)))....))))).(((((....)))))............)))))))))..))))((((.....))))..(((((((((((....(((((.....(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))...................((((....[[[[[[[[[[[.................))))....(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))....]]]]]]]]]]]....))).)))..))))))..)).))).)))))))))))((((......(((((((((.......((((((....))))))......)))))))))...((((((...((((...{{{{.))))}}}}..........))))))..(((((((.(......))))))))...))))...))))))).))))..))))))))))...(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))..((((.......))))...(((((....)))))))))))))))...
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((....(((.((.(((((..((.((((((..((((((......(((.(((((.(((((...((((((((..((((.((((((....))))))...(((......(((.((((..((.((((((....)))))).))...)))).))).((((((((............)))))))).))).)))).....((((((((....((((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....))))..))))))....((((((((((..((((.((((((...(....).)))))).).))).....((((.((.(((((...(((.(((...((((.....))))..))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).))))(((((.((((((((.(((((((..........)))))))..........((((...(((((((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..(((((((((....))))))).)).)))))....)))).....((((((.((..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))........((....)).))))))).)).))).))).)))))...))))...))))))))))))).....)))))))))).))))))))))).))))).......(((.....)))...))))).))))).)))((..((((...((((.....)))).))))..))...))))))....))))))...(((((.......((((((..((.....((((((((..(...((((((((((....((..((.(..((((((.....((((.((((..(((((((....((((.(..((....))..).))))..))))))).....)))).).)))......(((..((.((..(((((((((((.......(((.......(((.((((....(((....)))...)))).))).(((((.....))))).))))))))))))))..)).))...)))))))))..).)).)))))))))))).((((......(((((((((........(((((....))))).......)))))))))...((((((.((((((........))))))............))))))..(((((((.........)))))))...))))...)..)))))))).....))..)))))).(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..))))))))))))))..)))))))))).(((((....)))))))))))))))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((....(((((.(((.(((.....)))..))))))))......((...((((.........................................(((((((.(........)...(..((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))....((....))...))))........((((((......))))))......))).))))))))))))))..)..)))))))...........(((((((((...(((..((((((..........))))))...))).....((((.((.(((((......((((....(((......)))..))))......((((.((....(((...((((..((((((.........))))))..))))..)))...)).)))).))))).)).))))((((..((((((((...(((((.(........)..))))).........((((...((((.((((...(((((.((((.(((((((((...............))))))))))))).))))).((.((((..(((((((((....))))))).)).))))))...)))).....((((((.((..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))........((....)).))))))).)).))).)))..))))...))))...)))))))).))))......)))))))))..............................(((((((.((((....)))).))))).))...........................................................................................((((((((((..............((((((................(((((((....((((.(..((....))..).))))..))))))).............................((..(((((((((((....................................................((((.....)))).....)))))))))))..)).........)))))).........))))))))))...........(((((((((........(((((....))))).......)))))))))..................................................(((((((.........))))))).....................................(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..)))))))............)))).)).(((((....)))))))))))))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((....(((((.(((.(((.....)))..))))))))....((((..((((((..(((((.((.(((..((((((((.((((..........((((((((.(((....)))..(((.((((((((((((((..((....((((....(((((((((............)))))))))....((....))...))))((((....((((((......))))))))))..))..)))))))))))))).))).)))))))).(((..((((.((....(((((.....((((((..........))))))..((((.....((((.((.(((((...(((.(((...((((.....))))..))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).))))(((((.((((((((.(((((((..........)))))))..........((((...(((((((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..((..(((((....)))))...)).)))))....)))).....((((((.((..(((((((.((..((((((((((..(((....)))..))).)))))))..))........((....)).))))))).)).))).))).)))))...))))...)))))))))))))..............((((((..(((((((((((...(((.(((..(((((((..(((....)))..)))).)))((....))..........)))..)))..))))).)))).))...(((.........)))...))))))..)))).......))))).((....((((((....(((.(((......))))))..((((...(((...(((((((....((((.(..((....))..).))))..)))))))...)))))))...))))))..))...((.((..(((((((((((.......(((.......(((.((((....(((....)))...)))).))).(((((.....))))).))))))))))))))..)).)))).))))..)))....))))))))))))..)))))..(((((.((((((((........(((((....))))).......))))))))((((..(((((((((((........))))))...((.(((....))).)).(((((((.........)))))))......))))).)))).)))))....)))))......(((((((..((..(((((.(((..((..(((............)))..))..))).)))))..))..)))))))...........))))))))))((((....)))).))))))))))...