|
|
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAUGCGCUUGUCUUGAAGAUUUAGCCAUGCAAGCUAGCGAAGCCUUAUGGUGGAGCGGCGGACAGCUCAGUAAUACAGUUAUUAUUUACUCGUAGUAUGUAUACGGAUAACCAUGGUAAGCUAUGGCUAAUACGUGAACAGGUUAUUGCAUAGAUGAAACAGCGAUAACUGAGAGAGCAAUCGACUACGACUAAGUUUCUGGCCUAUCAGCUAGAUGGUAAGGUAAUGGCUUACCAUGGCUAUAACGGGUAACGGGAAAUCAGUGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUUCCUUAGCGGGAGAGGUAGUGAAGAGACAUGAAGUUCUACUUAGAGACUGUACGGUAAAAUAGUACAGGAUCUACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGCGCAUAUAAUAGUUGCUGCAGUUAAAACGUCCGUAGUUGAUCACAAGGUAUUCUUCUGCAUAGUAUUUGUGGAGUGUAUCUCGAUACUGUGAGAAAAAUAUGGUUCUCAAAGCGGAUUACGUGAGUAAUUUAGCAUGGGACAUGGUGAAUAUAGGAACAGAUGAUGGCAAUAGUAUUCAGCAGUUAGAGGUGAAAAUCGUUGACCUGCUGAGGACUCUCUGAAGCGAAAGCGAUUGUCAAGUAUGUCUCCGUUAAUAAAGGACUUAAGCUGGAGUAUCGAAGAUGAUUAGAUACCGUCGUAGUUCCAGCUGUAAACUAUGCCGACUAGGUGAGGCCGUCAGGCUGCGCCUUAGGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGCUCUGGGGAUAGUAUGGAUGCAAAUCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCAGGGCCGAAUGCAUAGGAGAUCGGCUGUCUGAGAGGGUACCCGAGAUUAUGCAGGAGGUGGUGCAUGGCCGUUUUCAACACGUGGGGUGGCCUGUCUGGUUAAUUCCGUAAACGCGUGAGGCCUGGGAAGCAAUUCAUUGCUUGACGGAUAGCGGCAAGCUAUAGGAAGACAGGCUAUAACAGGUCAGUGAUGCCCCUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUGGUAUAGUGAGACUAUGUACUGAAAAGUAUGCUUUAAGCUAUAUCGAAUCUGGGAUAAGCUCUUGUAAAUGAGUUUUGAACGAGGAAUUCCUAGUAAUCGCAGGUCAUAAUGCUGCGAUGAAUGCGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCACUAUCUUAGAUGGAUGUAUCGGUGAAAUGGCUGGACGAAAGAAAGGCAGUUGAACCUAUACAAUUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAAGGCUGCUAUAGGUGAACCUGUGGCAGGAUCAUUA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((.....((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((((............)))))))))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((...)))).....((((((.........))))))......(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.((((......................((((((.............(((.((((..........(((.....)))...)))))))..........))))))...)))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((....))))))))))...{{..))}}...}}}....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((......((((((((((....))))))))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((....))))))..((((((((.....))))))))...))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.........(((((....)))))........)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(...(((((.(..((((((...(((((.(((.(((.....)))..))))))))..((((((...(((....)))..(((((.((((.((.......(((.........((((((((.(((....)))..(((.((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))....((....))...))))........((((((......))))))......))).)))))))))))))).))).)))))))).(((((.((..(((((.((((((((..((((((..........))))))..((((.....((((.((.(((((...(((.(((...((((.....))))..))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).)))).....(((((((((.(((((((..........)))))))..........((((...(((((((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..(((((((((....))))))).)).)))))....)))).....((((((.((..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))........((....)).))))))).)).))).))).)))))...))))...)))))))))..................((((((..(((((((((((...(((.(((..(((((((.((((....)))).)))).)))((....))..........)))..)))..))))).)))).))...(((.........)))...))))))..)))).((((.....))))...((((((((((....((..((.(..((((((.....((((.((((..(((((((....((((.(..((....))..).))))..))))))).....)))).).)))......(((..((.((..(((((((((((.......(((.......(((.((((....(((....)))...)))).))).(((((.....))))).))))))))))))))..)).))...)))))))))..).)).))))))))))))...........(((((((((........(((((....))))).......)))))))))..))))))))((((((........)))))).)))))..)).))))).)))(((((((.........)))))))....))))))))))).........(((((.(((((.........)))))......))))).....))))).).......)))))).).))))).........(((..(((....))).........((((((((((....)))))))))).)))...) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.((((.(((......(((((((...((((((..((((((.(((..(((..((((((((((((.((((((((..((((.((((((....))))))...(((......(((..(((.((..((((((....))))))...)).)))..)))(((((((((............)))))))))))).)))).....((((((((....((((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....))))..))))))....(((((((((((((((..((((((..........))))))...)))..)))((((....(((((...(((.(((...(((((....))))).))))))....((((.....(((((.((((((..((((((.........))))))..))))..)))))))..)))).)))))....))))(((((.((((((((...((((((...........)))))).........((((...((...((((...(((((..(((.(((((((((...............))))))))))))..))))).(((((....(((((((((....))))))).))..)))))...))))..)).((((((.....((((((((((..(((((((...((...........))...)))))))..))).......((....)).)))))))....))).))).........))))...)))))))))))))......))))))))).))))))))))).)))))........)).))))..)))))))))...)))..((((....((((((....))))))))))..........))))))....))))))....((..((((...((((((..((.....(((((((..(((..(((((((((.....(((((.....(((((((((.(((...((((..(((((((....((((...(((....)))...))))..))))))).....))))..((((((((((((..((((((((((((((.....)))))..))).....))))))....(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))..)))))).))))))....))).)))..))))))..)).)))..))))))))).((((......(((((((((........(((((....))))).......)))))))))...((((((.....((((((.............))))))...))))))..(((((((.........)))))))...)))))))....))))))).....))..))))))...))))....)).((((..(((..(((.(((............))).)))..)))..))))...)))))))........)))....)))).((((((((....)))))))).))))))... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......))))).......................................................((((........))))..((((......))))..((((((((.......)....(((.((((((((((((((.(((............(((((((((............)))))))))...........................((((((......))))))......))).)))))))))))))).))).))))))).......(((.......)))(((((((.((((((..........)))))).).)))..)))((((.((.(((((...((((.(((..(((((....))))).(((((.................)))))((((..((((((.........))))))..)))).....))).))))...))))).)).))))............(..(((((((..........)))))))..)...........................((((.((((.(((((((((...............))))))))))))).))))....(((((..(((((((((....))))))).)).)))))........................((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))).......((....)).)))))))...........................((((((((((((...........))).........)))))))))..............(((((((.((((....)))).))))).))...................................((((....))))...............((((((..((.....((((((((((....(((((((((.........((.(..(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))...........................(((((((((((...........................(..((((((....))))))..)..(((((.....)))))....)))))))))))....))).)))..))))))..).))....))))))))).(((.......(((((((((.......((((((....))))))......)))))))))...((((((.((((((........))))))............))))))..(((((((.........)))))))....)))....)))))))))).....))..)))))).(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..)))))))...............((((((((((....))))))))))........ |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..(((((((...(((((...(.....(((.(((..(((.((...(((....)))...)))))......(((.......(((..(...((...(((((((.(((.((((.....(((((......)))))......)))).)))(((((((((............)))))))))....((....)).)))))))..)).)..))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).)...(((.(((...(((((....))))).))))))...)))))...................((((((.........))))))...(((((((((.......((((.....((....)).......)))))))))))))))))))).(((((...............((((...((((((.....(((((..(((((((.......))))))).))))).........((((((........))))))..((...((((....))))....))..((((((((.(.........................((..((((((((...((........))......))))))))..)).......((....))........).)))))))).))))))...))))...(((((((....(...((((.........))))...).)))))))....)))))((((((..((((.((((....)))).))))....((....))...)))....)))...(((........((((....))))....)))........(((((.(((((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))..(((.((((..(((((((((((.......)))...((((((((......((((..................))))((((....))))....(..(((((.....)))))..).))))))))...))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))).)...((((((((........(((((....))))).......))))))))...(.((....((((((........))))))....)).)..))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))....(..((.(..(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))...).))...)....((((((((((....))))))))))........ |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..........................(((((....(((.....)))...)))))...((.((((((......((((((....))))))((((((((.(((....)))..(((.((((((((((((((.(((..(((((...(.(((((((((............)))))))))).....))....((((.......))))((((((......))))))..))).))).)))))))))))))).))).))))))))......((((.....))))(((((((.((((((..........)))))).).)))..)))((((.((.(((((.(.((((.(((..(((((....))))).(((((.................)))))((((..((((((.........))))))..)))).....))).)))).).))))).)).)))).((.....)).(((.(((((((..........))))))).)))......)))))).))..........(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))(..(((((..(((((((((....))))))).)).))))))............((((((.....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))).......((....)).)))))))....))).)))....(...........((((((((((((...........))).........))))))))).....(....(...(((((((.((((....)))).))))).)))..........).......................((((....))))..............)((((((..((.....(((((((((((...((((((((((........((.(..(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))(((.....)))(.........)..(..(((((((((((.......(((((....)))......(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))..)))))))))))))..).))).)))..))))))..).))...))))))))))(((((......(((((((((.......((((((....))))))......)))))))))...((((((.((((((.(....).))))))..........()))))))..(((((((.........)))))))...)))))..))))))))))).....))..)))))).(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..)))))))...............((((((((((....))))))))))........ |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((...[[[.)))))..(((((.(((.((((...))))..))))))))........]]](((........[[[[))).....]]]](((((((....)))))))(((.[[[[)))....]]]].....((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))...............))))((((....((((((......))))))))))..))).))))))))))))))......(((....(((((..((((...)))))))))....[[[[[[))).......]]]]]]..(((....)))((((.(((((........((((...((((.....))))..))))(((......)))...(((((...((((..((((((.........))))))..))))....)))))..))))).)))).(((((...((((.((((((((...((((((...........)))))).........((((........((((...(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).)))))...(((((....(((((((....)))))))....)))))....)))).....((((((.....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).)))................)))))))....))).))).........))))...))))))))))))...((((.........)))).........)))))..((((((((....(((((.((((....)))).)))))....((((((....)))))).)))..[[[[.)))))..((((....))))....]]]].............(((....((((.....))))......[[[[[[...(((.(((......)))))))))....]]]]]]..(((((((....((((.((((......)))).))))..)))))))(((..((((.[[[[))))..)))....]]]]..(((((((((((......((((((....))).)))(((....((((((....)))))).....[[[[[)))..]]]]]....))))))))))).....(((.(((.(((.((((((...))))))..)))))).........[[[[[[[[[..)))..((((((....))))))......]]]]]]]]]...((((((.((((((........))))))...[[[[[[[[[))))))..(((((((.........)))))))............]]]]]]]]]...(((((..[[[[.(((((...)))))......))))).........]]]]......(((.[[[[[..)))...]]]]].(((..[[[....))).........((((((((((....)))))))))).]]].... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((..((.((((.((..((((((..((((((.((((((..((((.(((.(((....))).((((........)))).((((((....))))))....))))))).(((.((((..((.((((((....)))))).))...)))).)))(((((((((............)))))))))..((((((.((((((((((((.....(((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....))))..))))).((((.....))))((((((..((((((.((.....))))))))...)))..)))((((.((.(((((...(((.(((...(((((....))))).))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).)))).((.....)).(((.(((((((..........))))))).)))......)).))))))))))......(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).))))).)))))).....(((((((....))))))).))))))(((.(((((..(((((((((((..((((.(.(((((.((((((((((((.(((....))).)))).))))))))(((..((....((....))))..)))......((((((((((((..........((((((((...(((..((......))....)))...))))))))....(((((.((..(((((((.((((....)))).)))).))).(((..(((((...)))))..))).)).))))).(((((....)))))............)))))))))..))).((((.....))))...((((((((((....((..((....(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...))).((..((((((((((((..((((((((((((((.....)))))..))).....))))))....(((..((((((....))))))..))).((((.....))))...)))))).)))))).)).))).)))..))))))....)).)))))))))))).(((.((((....)))).)))..))))).((((....)))).(((...)))..((((........)))).((((........)))).....((.(((....))).)).(((((((.........)))))))....))))).)))))).)))))..)))))...)))...((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))).))))))....)))))).)))))).))........))))))))))... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.dddddd)))))............................................(((..................................................................((((((((((((((.((.............(((((((((............)))))))))....((....))................(((((......)))))........)).))))))))))))))....................((.......)).........((((((..........))))))...(((((((((((((.(((((........((((....((((....))))..))))...............(((((...((((..((((((.........))))))..))))..bb)))))..))))).))))....................((BB((((((..........))))))..)).........................(((([[.[[((((({{{{{{{)))))....))))..}}}}}}}....]].]].......((((..(((((((((....))))))).)).))))...............ccccc......(((((..((.((((((((((...(((....)))...)).)))))))).))........((....))..)))))............................((((((((...(((................)))...))))))))................(((((.((((....)))).)))))...((....))...)))))))))................(((....)))................................................((...................((((((..........(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))............................((((((((((...............eeeeee..eeeeee.............(((((.....<<....)))))>>.....))))))))))..............))))))........EEEEEE))EEEEEE.........((((((((.......((((((....))))))......))))))))....((((((....((aaaaa.....))......AAAAA....))))))..(((((((.........)))))))...........CCCCC.....................(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..))))))).............))).((((((((....))))))))DDDDDD.... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....(((((.(((.((((...))))..))))))))..(((..(...(((....))).((((........)))).((((((....))))))......).)))..((.((((.....((((((....))))))......)))).)).(((((((((............)))))))))..((((((.((((((((((((.......(((((......))))).(((((((.......)))))))................(.(((.((((.....))))))))....((((((.((.....)))))))).((((....))))((.((.(((((...((.((((...(((((....))))).))))))....((((.......(((...((((..((((((.........))))))..))))..)))......)))).))))).)).))...((.....)).(((.(((((((..........))))))).)))......)).))))))))))......(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).))))).))))))...((.((((((....))))))..)).((((...(((((..(((((((((((....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))).......((....)).))))))).....((((((((((((..........((((((((...(((................)))...))))))))....(((((.((..(((((((.((((....)))).))))).)).(((..(((((...)))))..))).)).)))))..((((....)))).............)))))))))..))).((((.....))))...((((((((((....(.........(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...))).((.....))..............(..(((((((((((.........(........)......(((..(((((......)))))..)))(((((.....)))))....)))))))))))..).))).)))..)))))).......).)))))))))).((((.......((((((((........(((((....))))).......))))))))....((((((....(((.....(.......).....)))....))))))..(((((((.........)))))))...))))...))))))).))))..)))))))))....(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))..((((.......))))...(((((....)))))))))))))))... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......))))).....(((((((((..........((((((((.((((((.....(((((((....((((........))))...............(((((.(((((((..((.((((..((.((((((....)))))).))...)))).)).(((((((((............)))))))))....((....)).))))))).))))).((((((......))))))..)))))))..))))))..))))))))....[[[[[[(((((..((((...)))))))))....((((((..........)))))).((((....))))...)))))))))....]]]]]]....((((.(((((...(((.(((..((((((((..(((((...((((..((((((.........))))))..))))....)))))..(((((...((..((((..(((.......((((.(((((((..........))))))).)))).......)))..)))).((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..(((((((((....))))))).)).)))))....)))).....))..)))))..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).))))).))))))).))........((....)).)))))))..)))))))).....(((((((((...((((((((...(((..((......))....)))...))))))))....(((((.((....(((((.((((....)))).)))))..((((...((((.....)))).)))).)).)))))..(((((((..................((((.((........((((.....))))...((((((((((....(((.......(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...))).((..((((((((((((..((((((((.(((((.....)))))...)).....))))))....(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))..)))))).)))))).)).))).)))..)))))).....))).)))))))))).))))))....(((((((((........(((((....))))).......)))))))))...((((((.((((((........))))))............))))))..(((((((.........)))))))...)))))))..))))))))).)))))).)))))...(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))...........))))((((((((((....))))))))))........ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....(((((.(((.((((...))))..))))))))..(((.((((.(((....))).((((........))))(((((((....)))))))...))))))).(((.((((.(((.((((((....)))))).)).).)))).)))(((((((((............)))))))))..((((((.((((((((((((...(((((((((..<<.<))))))(((((((.......)))))))....>>>.........(.(((.(((((...)))))))))....((((((.((.....)))))))).((((....))))......(((((...((.((((...(((((....))))).)))))).....................((((..((((((.........))))))..))))................)))))...................(((.(((((((..........))))))).)))...))))).))))))))))......(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).))))).))))))...(((((((((....))))))).))(((((...(((((..(((((((((((....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).)))................)))))))....(((((((((((((.......(((((((((((((.(((................))))).)))))))).)))(((((.....(((((((.((((....)))).))))).)).(((..(((((...)))))..)))....))))).(((((....)))))............)))))))))..))))((((.....))))..(((((((((((....(((((.....(((((((((.(((...(((...(((((((....((((.(((((....))))).))))..)))))))...)))...................((((....[[[[[[[[[[[.................))))....(((..((((((....))))))..)))(((((.....)))))....]]]]]]]]]]]....))).)))..))))))..)).))).)))))))))))((((......(((((((((.......((((((....))))))......)))))))))...((((((...((((...{{{{.))))}}}}..........))))))..(((((((.(......))))))))...))))...))))))).))))..))))))))))...(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((............))).)))..))).))))).)))..)))))))..((((.......))))...(((((....)))))))))))))))... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....(((.((.(((((..((.((((((..((((((......(((.(((((.(((((...((((((((..((((.((((((....))))))...(((......(((.((((..((.((((((....)))))).))...)))).))).((((((((............)))))))).))).)))).....((((((((....((((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....))))..))))))....((((((((((..((((.((((((...(....).)))))).).))).....((((.((.(((((...(((.(((...((((.....))))..))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).))))(((((.((((((((.(((((((..........)))))))..........((((...(((((((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..(((((((((....))))))).)).)))))....)))).....((((((.((..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))........((....)).))))))).)).))).))).)))))...))))...))))))))))))).....)))))))))).))))))))))).))))).......(((.....)))...))))).))))).)))((..((((...((((.....)))).))))..))...))))))....))))))...(((((.......((((((..((.....((((((((..(...((((((((((....((..((.(..((((((.....((((.((((..(((((((....((((.(..((....))..).))))..))))))).....)))).).)))......(((..((.((..(((((((((((.......(((.......(((.((((....(((....)))...)))).))).(((((.....))))).))))))))))))))..)).))...)))))))))..).)).)))))))))))).((((......(((((((((........(((((....))))).......)))))))))...((((((.((((((........))))))............))))))..(((((((.........)))))))...))))...)..)))))))).....))..)))))).(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..))))))))))))))..)))))))))).(((((....)))))))))))))))... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....(((((.(((.(((.....)))..))))))))......((...((((.........................................(((((((.(........)...(..((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))....((....))...))))........((((((......))))))......))).))))))))))))))..)..)))))))...........(((((((((...(((..((((((..........))))))...))).....((((.((.(((((......((((....(((......)))..))))......((((.((....(((...((((..((((((.........))))))..))))..)))...)).)))).))))).)).))))((((..((((((((...(((((.(........)..))))).........((((...((((.((((...(((((.((((.(((((((((...............))))))))))))).))))).((.((((..(((((((((....))))))).)).))))))...)))).....((((((.((..(((((((.((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).))........((....)).))))))).)).))).)))..))))...))))...)))))))).))))......)))))))))..............................(((((((.((((....)))).))))).))...........................................................................................((((((((((..............((((((................(((((((....((((.(..((....))..).))))..))))))).............................((..(((((((((((....................................................((((.....)))).....)))))))))))..)).........)))))).........))))))))))...........(((((((((........(((((....))))).......)))))))))..................................................(((((((.........))))))).....................................(((((((..(((.(((((.(((..(((.(((...(....)...))).)))..))).))))).)))..)))))))............)))).)).(((((....)))))))))))))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....(((((.(((.(((.....)))..))))))))....((((..((((((..(((((.((.(((..((((((((.((((..........((((((((.(((....)))..(((.((((((((((((((..((....((((....(((((((((............)))))))))....((....))...))))((((....((((((......))))))))))..))..)))))))))))))).))).)))))))).(((..((((.((....(((((.....((((((..........))))))..((((.....((((.((.(((((...(((.(((...((((.....))))..))))))....((((.((...(((((..((((..((((((.........))))))..)))).)))))..)).)))).))))).)).))))(((((.((((((((.(((((((..........)))))))..........((((...(((((((((...(((((.((((.(((((((((....(((.....)))))))))))))))).)))))...(((((..((..(((((....)))))...)).)))))....)))).....((((((.((..(((((((.((..((((((((((..(((....)))..))).)))))))..))........((....)).))))))).)).))).))).)))))...))))...)))))))))))))..............((((((..(((((((((((...(((.(((..(((((((..(((....)))..)))).)))((....))..........)))..)))..))))).)))).))...(((.........)))...))))))..)))).......))))).((....((((((....(((.(((......))))))..((((...(((...(((((((....((((.(..((....))..).))))..)))))))...)))))))...))))))..))...((.((..(((((((((((.......(((.......(((.((((....(((....)))...)))).))).(((((.....))))).))))))))))))))..)).)))).))))..)))....))))))))))))..)))))..(((((.((((((((........(((((....))))).......))))))))((((..(((((((((((........))))))...((.(((....))).)).(((((((.........)))))))......))))).)))).)))))....)))))......(((((((..((..(((((.(((..((..(((............)))..))..))).)))))..))..)))))))...........))))))))))((((....)))).))))))))))... |