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CACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAUGCUUGUCUCAAGGACUAAGCCAUGCAAGUCUAAGUAUAAGUGAUUCUGAUGACGAAACUGCGAAUGGCUCGGUAAAACAGCUAUAAUUUCUUCGAUGGUAACUUACUAUUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCCACAAAUGCGGGGUUUCGGCUCCGUGGUGCCAAUUAGAUAACAACACCAACAUUUGGUGAUUCAUAAUUUUCUUUCUGAUCGCUGCAUGCAUUGCGGCGACGCAUCGUUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUUUCGAUGGUAAGGUAGUGUCUUACCAUGGUGGUGACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGACUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCGGACUCCGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAUCAAUAGGGGACCCGAUGGGUGCCCUAAUUGGAAUGAGAACAAGGUAAACAGCUUAUCGAGGAUCCAGCAGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCUGUAAGCGUAUACCAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUCGGAAGUUGGUGGUCUUGCGGGUGCGCGCGUUGAGCGUACGCCUGUCGAGGCUGCUUUUGUGGAUUGCGCGCACGGGCGGCUUUAGUGUCGAACGUGUUGGGUUUCGCUGCUUUGGCGUUCACGCGGCAGAGCGGCGGAGGCGCAGCCACCGUUUACUGUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGUUUGCCGUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACUCGGUUUUCCUAUUUUGUUGGUGUUGUGAGGGGCGAGUAAUGAUUAAGAGGGACAGUUGGGGGCACUUGUAUUCCGGCGCUAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUGCCGGAAGACAAACCGCUGCGAAAGCGUCUGCCAAGGAUGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUAUAAACGAUGAGGACUGGGGAUCGGGCGUGGAAUUGCGAUGACCCGCCCGGCACCCUCCGGGAAACCAAAGUUUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCAGGACAUAGUGAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGGGCGUGCUAAAUAGGGGCUAUUACCGCUUUUUUUGGUAGUGAGAGCUUUUUUGACCCCUUCUUAGACGGACUGCGGGCGUCUAGUCCGCGGAAGCUCCAGGCAAUAACAGGUCUGAGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAGCGGAUCAGCGGGCGAGGAUGCGCGAAAGCGUUUCCUAAUCCCCAAAUCCGCUCGUGCUGGGGAUAGAGGGUUGCAAUUCUCCCUCUUGAACGAGGAAUACCUUGUAAGCGUGGGUCAUCAUCCCGCGCUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGGUCCGGUGAGGCCUUGGGAUUGUCGUGAGGGGAGCGUUUGCGCUCGUUUCGUGAAGAAAACUUGGUCGAACCUUAUCACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGCU |
| Reference structure (ext) |
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Afold
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[ FASTA input ] |
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(......(((((((((((..(((((((((((((((...((((.((....((((........))))...)).))))...)))...((((((.((((((.(......)))))))......((((((((((...))))).)))))....)))))).....(((((((....(((.........(((((((....)))))))..(((..............((((((...))))))....................((((((((.....)))))))).)))...............(((..(((.((..(.(((((((((.....))))))))).).)))))..))).))).(((((((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((..((..((((((...(((((...))))).))))))...........(((((((((.((((...)))).)))).)))))..((.((.(..(((((.....)))))...).)))).......))..))))).)))).))).)))))))......))))))).))))))))))))...(((((((.(((((..(((..((((.(((.....((..((((((((((((..(((.....)))..)))))).))))))..))....(((.((((((.((((..((((......))))..))))......((((((((((((.(((....))).)))))))))))).)))))))))))).)))).)))...........(((((((..((((....))))..))))))).)))))..((...((((((((((((........))))))))))))(((((((..((((((.((..(((.((((((((((.(((((((((((.((((.((((((((((((((......))).)))..)))))))).))))......((....))((.((((.(((....((((((..((.(((((((..........(((((....))))).....((((((...(((((..............(((..(((..(((((((.((...........)))))))))..)))))).........(((((((((((..(....)..)))).((((....))))))))))).)))))..))))))....((((((((((.(((((((...((..(((((((((.(((.....)))....(((((...((....))...)))))......))))))))).))..........))))))).)))))))))).....))))))).))..))))))...((((.((.((((((...)))))).)))))).))).)))).)).....(((((((.((((..((......))..)))).))))))).)).))))..(((((((...((((((((.....))))))))..((.....))........)))))))..((((((...((((((.(((.(((....)))......((((((((..(.(((..((((.((((....)))).))))...))))..))))))))..))).))))))))))))..))))).)))))))))).(((((....)))))..((((((((.......)))))))).....)))..))))))))..)).)))))..))....(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((.((((((((.(((((....))))).))))))))..))..)).))))..)))..))))))))).)).))))).....))))))))))....(((((....)))))...))))))))..) |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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...(((((.......))))).........................(((((((((.......(((...........)))........)))..))))))...................................(((((..........)))))..........(((((..((((......(((((..........)))))))))..)))))........((((.....)))).....................((((((((.....))))))))..................................((((((((.......))))))))........((((.......((((....))))....(((((..((.((((........)))).))...)))..))....................((((....((((...))))..))))..............(((((((((((((...)))))))))).)))....................................((((((...................................))))))...............................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((((((....)))..)))))))))).....................(((((((..((((((......(((.((((((((((((((.....................))))))))))))))....(((....)))...))).....))))))..)))))))..........((...........((((.........))))........))..................(((..((((((((..............))))))))..)))...((....))..........................(((((....)))))........................((((((((........................................................................................................)))))))).........................................................(((((.(((.((((..(((((.(...............................)...)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))......................................................((((((((....(((...((((((((....))))))))....)))...))))))))......((((.((((((..........))))))....................(((((((((.....))))))))).......))))..................))))...(((((.((...(((((((((((((..((((..(...((((((((((((((((......))))))))))))))))...)..))))..)))))))))))))..)).)))))...............(((.(((((....))))).))).......... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((.....(((((((((((((........((((((((((........................................)))))))))).............................((((((..(((....)))))))))........(((((..((((((......((((((....))))))))))))..))))).......((((((...))))))....................((((((((.....))))))))..(................((((((((.((..(.((((((((((...)))))))))).).))))))))))..............)..(((.((((((..(((((((........))))...................................)))..)))))).))).....................((((((((((((((...)))))))))).)))).................................................................................)))))))))))))...................((.(((((((.......(((((((((((((((((((((.....))))))))))).))))))))))......))))))).))((((((((..........(((((.((((.((((((((((((((((((....))))))))))))))))).).))))...))))).................(((((((((((((....)))))))))))))............(((((((((((((........)))))))))))))........(((((((........((((((((((((((((.......((((((((((((((((.(((......))))))..)))))))))))))........((((((((((.....))))))))))........................(((((....))))).....(((((.(((((((((..........)))))))))....(((((((.((...........)))))))))..((((((((((((.((((...)))))))))))))))).................................)))))(((((((((............(((((((((((..........................(((((((............((((((((((((.(((((((((.............((..............)).............))))))))).))))).))))))).............))))))).(((.(((((((((((((......(((((...........)))))......))))))))))))))))..((((((((.....)))))))))))))))))))..............)))))))))..........................(((.(((((((((.(.((((((((((((((....))))))))))).)))).)))))))))))).................))))))))))))))))((((((....)))))).((((((((.......)))))))).....)))))))..............))))))))..((((((((..(((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((....)))))))))))))))))...))))))))))))))))))))))).))))))))...................(((((....)))))...))))))))... |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((.......))))))).....(((((((((....(((....((((((..(((.......((....)).....)))..((((((.(((((((...................(((((((.(((.(.((((((..(((....))))))))).)..............((((.....((((((((....))))))))((.((((((((.......((((..(((.(((...(((.....((((((........((((.(((..((((....))))...........(.(.((((.....((..(.((((((((.......)))))))).).))....)))).).)..(((......)))..((..(((..((.((((........)))).))...)))..))...)))))))........((((((...((((.....)))).))))))...))))))........)))...)))))))))).).))))))).))........)))..)..)))..)))))))..(..(((((.......((((.....((....)).......)))))))))...)..........)))))))))))))..(((((.((((.(((.(((........))).))).)))).)))))..((..((((((((.............((((.(((((((((((..((((......))))..))))).....((((((((((((.((......)).)))))))))))).))))))))))..(((........)))...............))))))))..)).............))))))..(((((((((((((........)))))))))))))..))).....)))))))))..............(((...((((((......(((((((.((((.(.......).))))...))))))).............((((((((((.....)))))))))).................((((((....(...((((.........))))...).))))))...............((((((.(((((((.((...........)))))))))....)))))).((((....)))).))))))))).(((......((((....))))....)))........(((((.(((((((...(((.(((.(..((.....)).........).)).).))).........(((((((..(.....((..((((((((((((.((..(((((.((..........(((.(((........)))))).......)).)))))..)).))))).)))).)))....))...)..)))))))((((((......((((...(.((((.......)))))((....))........)))).((((((((...((((((((.....))))))))..((.....))........)))))))).((((...........)))).))))))......(((.((((((((....(((...(((.((((....)))).))).....)))..)))))))))))...((((.((((((..........)))))).....((((....))))...((((((((.......)))))))).......)))))))))))))).))....(..((...(((((.....(((((((((..(((..((((..(......((((((((.(((((....))))).))))))))......)..))))..)))..)))))))))....)))))....))...).((((((........))))))................ |
|
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......))))).(((((((((((..(.....)(((.((((((((.(((....(....((.....)).....)...)))))..)))))).)))........................(....((((((..(((....)))))))))..).....(((((..(((((......(((((((....))))))))))))..))))).......((((((...))))))....................((((((((.....))))))))((((((.........((((((((.((.(((..(.((((((((((...)))))))))).).))))).))))..)))).....))))))....(((((((.((.((((........)))).)).).)))..))).(((.((.(((((.((....((((.(((.((.((((....((((...........))))....)))).)).)))))))(((((..(((((..........((((.......)))).....)))))...))))).....))))))).)).)))..((.....))........))))))))))).......................((....))......((((((((((((((((.((((.....)))).)))))).))))))))))...((((.(((((((((((..((((......))))..)))))....(((((((((((((.(((....))).)))))))))))))))))))))))......................(((((((..(((((())))))..))))))).............((((((((((((........))))))))))))(((((.((((((((((........((((((((((.(((((..(((..((((.((((((((((..(((.......)))))..)))))))).))))...)))..((((((((((.....)))))))))).........((((...........(((((....))))).....(((((.(((((((((..........)))))))))....(((((((.((.(((())))..)))))))))(.(((((((((((..(((.....))).))))))))))).)...((((....))))................)))))(((((((((..(((((((...(((((.(((((........(.......).........(((((((.(......((..((((((((((((.((..(((((..((.....(((.((.((((........)))).)).)))..)).)))))..)).))))).))))).))....))...)..))))))).(((.((((..(((((.((.....((((((.........)))))).....)).)))))..)))))))..((((((((.....))))))))))))).)))))....))..))))).)))))))))....))))......((((()))))..(((.((((((((..(.(((..((((.((((....)))).))))..))).)..))))))))))).................))))).))))))))))((((((....)))))).((((((((.......)))))))).....)......)))))))))..)))))...((.(.(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((.((((((((.(((((....))))).)))))))).))...)).))))..)))..))))))))).)).)))))..).)).........(((.(((((....))))).))).......... |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((.......))))..........................(((((((((.((....((((.........))))......)))))..))))))..................................((((((..((....)))))))).................(((......((((.((......)).))))))).((((((.........((((.....))))......)))))).........((((((.........))))))..................................((((((((.......)))))))).......((((((......((((....))))...((((((...((((((........)))).))...)))..))).........((((((..((((((...(((((...))))).))))))............(((((((((((((...)))))))))).)))....................................((((((...................................))))))................................................(((((((((((((((((.(((.....))).))))))).))))))))))......(.......(((((..((((......))))..)))))................................................).....................................(((....)))......................((((((((((((...)...)))))))))))...............................((((((...((((((((((((.(((((((.((((((......)))).))...))))))).))).........((((((((((.....)))))))))).................(((((((...(...((((.........))))...))))))))...........((....(((..(((((((.((...........)))))))))..)))...((....))..........))...........(..(((((....)))))...)............((((....(((((((((....(((..((((.......................(....)....)))).)))..(((((....((..(..............)..))......)))))..)))))))))....)))).................................................(((((.(((.((((..(((((((((((((.........)))))))...........).)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))...............)))))))))...)))))).........))))))..(((.(((((((.....(((...(((.((((....)))).)))....)))....))))))))))..(((((((((((............)))))....(.(((....))).)..((((((((.......))))))))......))))))................))))))..(((((.((....(((((((..(((..((((..(...((((((((.((.(((((....))))).)).))))))))...)..))))..)))..)))))))...)).)))))..............((((.(((((....))))).))))......... |
|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
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((.(((((.......)))))))......(((((.(((.((.(((.(((((((((.((....((...((.....))....))...)))))..)))))).)))......(((((..((..((((((((((...))))).))))).))..)))))....)).)))(((((..(((((((....((.((...)).))...)))))))..))))).......((((((...))))))...........((((((((.((((((((.....))))))))........(((......))).((((((........((((((((.....)))))))))))))).(((((((.....(((((((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((..((..((((((...(((((...))))).))))))...............(((((.((((...)))).))))).(((((....((...((((.....)))).)).....)))))......))..))))).)))).))).))))))).((((((((((((((.(((...........)))))))).......((.(((((((.......((((((((((((((((.((((.....)))).)))))).))))))))))......))))))).))(((..((((......))))..)))((((.((((((((((((((.(((....))).))))))))).))))).))))(((........)))...........(((((((..((((....))))..)))))))...))).)))))).(((((((((((........))))))))))).(((((.(((((((((.((..(((.((((((((((.(((((.((.(..((((.((((((((((((((......))).)))..)))))))).)))).((((((.((((((((((.....)))))))))).....(((.(((((....((((((.(((..((((.........(((((.(((((((((..........))))))))).))..)))(((......))).....(((((((((..(((((((..((.((.(((((((.((((..((.((.........)).)))))).)))))))...))..))..))).)))).....))))))).)).(((((.(((((.......(((.....)))........(((((((............((((((((((((.((..(((((..((.....(((.((.((((........)))).)).)))..)).)))))..)).)))).))))))))((((....)))).))))))).(((.((((..(((((.((.....((((((.........)))))).....)).)))))..)))))))..((((((((.....))))))))))))).)))))........))))..))).))))))..)))))))).((((.((.(((...))))).))))..))))))...((((.((((....)))).)))).(((((((.....((....))))))))).....))).))))).))))))))))((((((....)))))).((((((((.......)))))))).....)))..)))))))))..)))))))))))))).(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((.((((((((.(((((....))))).))))))))..))..)).))))..)))..))))))))).)).)))))..((....)).((((((((...)).)))))).)))))))).))))). |
|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(.(((((((((((...((((((((((((........((..(((((((((.(((..(((((((....)).)))))..)..)))))..))))))..))..............................((((((..((....))))))))......(((((......(((.....(.(((((........))))))))).((((((.........(((((...)))))......)))))).........((((((((.....))))))))....................((..(((.(...(.(((((((((.....))))))))).)..))))..))....(((((((((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..)))..(((.(((((..((..((((((...(((((...))))).))))))........((.((((((((((((((...)))))))))).)))).)).................((.................)).))..))))).)))..))).)))))))....)))))))..))))))))))))....(((((((.............((((.((......(((((((((.(((((((((((.....)))))))))))..)))))))))...(((((...........(((((......................((((((.(...((.((......)).)).)...)))))))))))))))))).))))................((((((..((((....))))..)))))).............((((((((((((((....)..)))))))))))))....................((((((((.((((((.((...(((((((((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).))))).....((....))...))))..)).)))))).))))))))...((....)).....(((((....))))).....(((((...(((((((..........))))))).(((..(((((((.(.((......))..))))))))..)))....(....)..((((....(((..(....)..)))..((((....))))...)))).........)))))...(((.((((.....)))).))).......................(((....))).............................(((..((((....))))..))).....((((((((((((..((.((((...((((.((((((((((.....)))).)))))).))))))))..(.(((((..((.((((..(((((((((((((.........))))))).).)..........))))..))))))...((((((((.....)))))))).....)))))).................((((..((.....))))))..............((.((((((((.(..(((((((((.((((....)))).)))).))))))..))))))))))...((((((.(((((..........)))))....((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......))))))))....))))).))))))).....(((((.((..((((((((((.(((..((((..(...(((((((((((((((((....)))))))))))))))))...)..))))..))).)))))))))).)).))))).....))))))))))..(((((((....))))))).))))))))..) |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((........((......(((((((((((..((((....(...(((((((((.((....((((.........))))......)))))..))))))...)....(((......((....(((((.............(((....)).(((.....)))..........).((......(((((..........)))))))((((((((((.......((((.....))))...)).)))))))).....(.((((..((.....))..))))).)))))...))....))).(((....(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))((..((.((((........)))).))...))........((.((....))))..((((((...(((((...))))).))))))..(.........(((((((((((((...))))))))).))))....).((.................))))))....((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))))))))))))))(((((....(.........(.((...(((..........((............................).....)...........................................................((....)).................(.......)...............(((((.......((...((((...))))(((....))).....))......)))))(....)........(((((((((..(..................))))))))))(((((.......(((((.((...(((((((((.((((((((((.((((......))))))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)).)))))))))))))...)).)....(((((((.......((((.........))))....)))))))......(...(((.((((((..((((((((.(((.......)))))))))))..)))...((....))..))).....))).((....)).)...((((....))))).)))))...))...((((((((((((..(((.....)))(.((.((((((.....(((...)))......((...)).(((((.(((..(((((............(((..(((......)))..))))))))..))).((.((((..((((((...(((((..((....))..))(((......)))..))))))))((((((((.(((.((((..(((((.((...........................)).....)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))..........))))..))))))........))))))))))).))...)..(((.(((((((.....(((...(((.((((....)))).)))....)))....))))))))))..((((((((((((..........))))))...((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))))))))((....))....))))(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...((((((((((((((((......))))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).)))))....))...)).)))(((((((((....))))))))).......... |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((((((((((...................................................................................................................................................................................(......))))(((.......(((((..........)..................)((..(...((((..((((...(((((.....((((((.((((.....(((...((((.(((.......(((((......((((...........)))))))))((((((.((......((((...................)))).))...)))))).(...(...((((.((((.....)))))))).)....).(((((((((((.(((....(((....(((((((.......))))))).))).....)))...))))((((....))))..((((...((.((((((........)))).))...))...))))((((((((((..((...(((((...(((.....))).)))))(..........(.(((((((.(.)))))))...)).).......(((.....(...)..)))))..))))))))))...(((((((((.(((((.((((.......(.(((((....((((.....(((....(((((.....((........(((...................))).........)).(((((...........................(((..........((.((((...................(...(((....))).....)....))))..(...((((((((.(((......)))........)))))))).)(((((((...(((((.(....(((((((((((((..((((.......))).)...))))))))).)))....(((....)))..)....)...)))))...))))))).)).....))).))))))))))..))......((((((....(((...(((........((.(((((..((((((((.(((.......)))))))))))..)))..............)).....))...))).))).).)))))..)..))))..)))))....)...........)))).......)))))...))).)))))).))))))))))......))))...))))))).....)))))).)))))..))))...)))).)....)).(...((..((((((((((.((((((((...(..((((((((((((.....))))).))))))))))))).(.(((((((((.((((..(((((...(.((..........)))...)))))..)))))))(.((((((((.....))))))))...)))))))...)..............((((...((...)).))))(((((.....((.....((((((((..)))))))).....))......)))))........(((((((((((..........))))))...((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......))))).)))...)))))..))))))).)(((((((...(.((((..(((..(((......((((((((((.......))))..)..))))).....).))..)))..)).).))..)).))))).)))...))).))).((((((((....)))))))))))))))... |
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Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(.(((((((((((..((((((((((((..........(..(((((..........................................)))))..)..................((((.(((((...)))))..))))................((((((................(((((((....)))))))(((((..............((((((...))))))....................((((((((.....)))))))).))))).............(((..((..((..(.(((((((((.....))))))))).).)).))..))).....(((((((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((..((..((((((...(((((...))))).))))))............((((((((.((((...)))).))))).)))...........................................))..))))).)))).))).)))))))......))))))..))))))))))))....((((((.........((.(((((((.(.....((..((((((((((((..(((.....)))..)))))).))))))..))....).))))))).))((((((((...........(((...(((.(.((((((((((((.(((....))).))))))))))))..).))).....)))..................(((((((..((((....))))..))))))).............((((((((((((........)))))))))))).(((.((..((((((.((..(((.((((((((((.(((((.........(...((((((.......................))))))...)..........((((((((((.....))))))))))...........((....))........................(((((............................(((..(((((((.((...........)))))))))..)))...((....))..........((..........))....(((....))).................))))).............................................................................................((((((.................(((((((.((((((.......(((..(((((.((((.....))))..)))))..)))...........................))))))))))))).............))))))............((((((((...((((((((.....))))))))..((.....))........)))))))).....................................((((((((..(.(((..((((.((((....)))).))))...))))..))))))))....................))))).))))))))))((((((....)))))).((((((((.......)))))))).....)))..))))))))..))))).))))))))..(((((.((..(((((((((..(((..((((..(......((((((((.(((((....))))).))))))))......)..))))..)))..))))))))).)).))))).....)))))).)))....(((((....)))))...)))))))).). |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((.......)))))))......(((((((.....((((...((((((...(((((.....(((((((((((..((((((((((.((..(((.((((.....(((......((((((((......((((((..(((....))))))))).....(((((....((((((......(((((((....)))))))(.((((.............((((((...)))))).(((........(((((((.((((((((.....))))))))((((((...((....(((((((..(((.((..(.(((((((((.....))))))))))..)))))..)))..))))...))))))))......)))))))((((((........)))).))........))).)))).).))))))...((((((...(((((...))))).))))))...........(((((((((.((((...)))).)))).)))))..................)))))))))))))....((((((.......((((((((.((....))))))...)))))))))).)))...))))..)))..)))))))).......))))..))))))...((..((((((((((((..(((.....)))..)))))).))))))..))...((((.((((((.((((..((((......))))..))))......((((((((((((.(((....))).)))))))))))).))))))))))...))))).........)))))(((((((..((((....))))..)))))))....))))))..(((((((((((((........))))))))))))).......((.(((((.((..((....((((((.(((.....((((.((((.((((((((((((((......))).)))..)))))))).))))......((....))...))))..((((((.(((...((((....((((..(((....(((((....)))))...)))..))))((((((((..........))))))))...)))).(((((((.((...((((((((.((((((.(((((((((((..((((...)))).))))))))))).....((((....))))..((((....(((((..(.((((((((.....(((((.....)))))...(((((((((.(((.....)))....(((((...((....))...)))))......))))))))).)))))))))..)))))..)))).((((..(..((.(((((...(((..(((((((((.......))).))))))..))))))))...))...((((((.....(((((..(.....((((((.........)))))).....)..)))))((((((((...((((((((.....))))))))..((.....))........)))))))).((((...........)))).)))))))..))))...((((((((....(((..((((..(((....)))..))))...)))...))))))))..))))))...((((((..........))))))...((((((....))))))......)))))))))).)))))))))).)))))))))))))))...)).))))))).)).(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((.((..(((..(((((....)))))..)))..))..))..)).))))..)))..))))))))).)).))))).))))..........(((.(((((....))))).))).)).))))). |