|
|
|
ACGGUGCCCGACCCGGCCAUAGUGGCCGGGCAACACCCGGUCUCGUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCACGUCAGAACGGCCGUGAGGUCCGAGAGGCCUCGCAGCCGUUCUGAGCUGGGAUCGGGCACC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((..((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).)))))))))
|
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.....((((((..(((...)))..))))..))....)))))))).((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.((((..((((..(((...)))..))))..)))..))))))))).((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((((((....((((((((.((((..((((..((.....))..))))..)))..))))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))....... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.((((..((((..(((...)))..))))..)))..))))))))).((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.........)))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.((((..((((..(((...)))..))))..)))..))))))))).((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.......((((..(((...)))..))))........)))))))).((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((.........((.(((((.....((((((...(.....)...))))..))....))))).))((((((....(..(((((.((....))))))).).....)))))).....))))))))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((.........((.(((((.....((((((...(.....)...))))..))....))))).))((((((....(..(((((.((....)))))))..)....)))))).....))))))))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((..(.((((((((.((((..(((((.(((...)))).))))..)))..))))))))))((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((......(((((((.....)))))))...........((((........)))).....((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....(((((((((((((..((((.(.(......)))).))..))).)))))))))).((((((((((.((((((.(((..)))))))))).))))))))))))))).))))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((.((((..((((..(((...)))..))))..)))..))))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.((....)))))))).)))))))))))))))).))))))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((((((((((.....))))))).....((((((............((((........))))......(((((((((.((((((((.....)))))))).))))))))).)))))).))))))))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((((((((((.....))))))).....(((((.((((.((((....))))........(((((((........[[[[))).]]]].(((....)))...))))...))))))))).))))))))) |