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GGCAGCGGCCAUAGCGGUGGGGCGACACCCGUACCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGCCCACCAGCGUACCGGGAAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAGCGGGGUUCGCCGCCUGCCC |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))).)))).
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..(((.....)))..(((((..(((((.(((.(((((....))))).....((......)).....))).....(..(((.((....)))))..)...)))))..)))))..))).)) |
|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((....((((((((................(((((....)))))......)))))).)))).............((((.((....))))))......................... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))..(((........((((((.((....)))))))).......)))..))))).)))). |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((....................................))))))................((((((.........))))))............)))).))))). |
|
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...)))).))))). |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..............(((((..(((((.(((((((((....))))).....((.(((((..((((......))))))..))).)).......))))..)))))..)))))).))))). |
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CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((....((((((((....(..((((.............))))..).....)))))).))(.(((..(.....((((((.((....))))))))....)..))).))))))...... |
|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...(((.......((((((.((....))))))))....))).....)))).))))). |
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Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((....))))(((((..(((((.(((((((((....)))))(....((.(((((..((((......))))))..))).))...)...))))..)))))..)))))).))))). |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...((((......((((((.((....)))))))).....))))...))))).)))). |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((.............))))..)))...)))))).((.((((((......))))..)).))((((((((....)).)))))).)))).))))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........(((((.[[[[..[[[[[.[[[.(((((....))))).......)))))...................................]]]..]]]]]..]]]])).))))). |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((................(((((....)))))......)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))).)))). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((.....))........(((((....))))).......))))).))....(.....)..((((((((.....))))))))............))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..........)..(((..(((((..((..((((....))))...................((((......))))...............))...)))))..)))))).))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.(...((((((.............))))..))...))))))).))..(((........((((((.((....)))))))).......)))..))))).)))). |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).............(..(((.((....)))))..)............))))))).... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))...(((((.....((.(((.((....))))).))....)))))...)))).))))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....))))))))..).))))).).)))).))))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))...(((((.....((.(((.((....))))).))....)))))...)))).))))). |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...)))).))))). |
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PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.[[.)))...]]((((((((((..(((((.(((.(((((....))))).....((......)).....))).....((((((.((....))))))))...)))))..))))).)).))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((..[[[..[[[[[.[[[[(((((....))))).......))))).))...((((......))))((.((....)))).]]]]..]]]]]..]]]))).))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((................(((((....)))))......))))))......((((......))))...........(((((.....)))))...))))).)))). |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((......((((((................(((((....)))))......))))))....(((......)))((((((.........))))))............)))))...... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).............(..(((.((....)))))..)............)))).))))). |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....)))...((((.(.(((((..(((((.(((.(((((....))))).....((......)).....))).....(..(((.((....)))))..)...)))))..))))).))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....(((....))).(((((..(((((.(((.(((((....))))).....((......)).....))).....((((((.((....))))))))...)))))..)))))..))))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((....))))(((((..(((((.(((.(((((....)))))((...((......))..)).))).....(..(((.((....)))))..)...)))))..))))))).)))). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....((((((((.(.((....)))))))((((((..))))))...)))).((((((..((((...).))))))..)))..((..((((........))))..))))).))))). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).............((((((.((....))))))))............)))))..))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....)))...((((.(.(((((..(((((.(((.(((((....)))))...............................................)))..)))))..))))).))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((.............))))..)))...)))))).))..(((........((((((.((....)))))))).......)))..))))).)))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....))).....((((((((((..(((((.(((.(((((....))))).....((......)).....))).....(..(((.((....)))))..)...)))))..))))).)).))). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((......))).))).(((.(((((....)))))......(((......((((......))))..(((.((....))))).))).....)))...)))).))))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((......))).))).(((.(((((....)))))......((((.....((((......))))..(((.((....))))))))).....)))...)))).))))). |
