RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_01491

RNA: CRW_01491
Rfam family: 5S_rRNA

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.(((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)).)))))))))...
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((........(((((.((..((.((((.............)))).))....))))))).(((.(((.....((.((((((.((....))))))))..))...))).))).)))).)))..))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................(((((.....((.((((.............)))).))......))))).(((.(((..(.....((((((.((....))))))))....)..))).))).............
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((.((...((((((.............))))..))...))))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).)))).))))...
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((.....(((((((......................................))))).)).............((((((.........))))))..............))))))))))...
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......((((((((....((.((((.............)))).)).....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))......))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((.....(..((((.............))))..)......))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).)))).))))...
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(..((....(((((((.....((.((((.............)))).))......))))).))(.(((..(.....((((((.((....))))))))....)..))).)))..)..........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((......(((((((.....((.((((.............)))).))......)))).)))..(((..(...(.((((((.((....)))))))).)..)..))).....)))).))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((((....))(((((.....((.((((.............)))).))......))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).)))).))))...
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.[[[[(......{{{{{{{.))))))........(((((((....((((......))))..)]]]]......(((((......)))))....))))))).........}}}}}}}.........
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..((((......((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...)...)))..)))...
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((....(((.....))).[[[[))))))..............]]]].((((......))))....((((((((((.......)))).[[[[......))))))......]]]].............
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((.....))).))..)))))).((((.......((((...((((......))))....))))......)))).((.(((((..(((.((((((...))))))..)))..)))))))...
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((..((.((.((((.............)))).)).))...))))).(((.(((.....((.((((((.((....))))))))..))...))).))).)))).))))...
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((.((..((.((((.............)))).))....))))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).)))).))))...
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((...((((((.....(((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).)...((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..)).))))...))...
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((....((((((((....((.((((.............)))).)).....)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..))))))))).......
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........((((((....((.((((.............)))).))....).))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).)))).))))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..)))....[[[[[[[.)))))).....((((((((((.(((((((...................))))))).................)))))))....)))..]]]]]]].........
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..((((........(((((.((..((.((((.............)))).))....))))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).))))..)))...
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((((....((((((((.......((((.............))))........)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...)))))..........
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((......((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....)))))))).)..))))).)....)))))))))...
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((......((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....))))))))..).))))).)....)))))))))...
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..)...))))))))....
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))......))))))))....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((..((.((.((((.............)))).)).))...))))).(((.(((.....((.((((((.((....))))))))..))...))).))).)))).))))...
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.(((((........((((........)))).....(((((((....((((......))))....((((..((((.......))))...)))).)))))))............))))).))))...
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((.......(((((........((((.............)))).........)))))................((((((.........))))))..............)))))........
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((......((((((((.......((((.............))))........)))))).)).............((((((.((....))))))))...............))))))).....
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((((....))(((((..((.((.((((.............)))).)).))...))))).(((.(((.....((((......))))(((((....))..))).))).))).)))).))))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..((.....))(((((.(...((((...(..(((((((..(((((..((((.((........))))))...)))))..((..)).(..)))))))))..)))).)))))))))))))).).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((....(((((((......(.((((.............))))..)......))))).))..((.........((((((.((....)))))))).......))...)).)))).....)..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((.....((.((((.............)))).))......))))).(((.(((....................................))).))).)))).))))...
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........((((((....((.((((.............)))).))....).))))).(((.(((........((((((.((....)))))))).......))).))).)))).))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((........(((((.((..((.((((.............)))).))....))))))).(((.(((.....((.((((((.((....))))))))..))...))).))).)))).))))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((......((((..((((....................)))).((((......))))))))......((((.......)))).(((..((............))..))).)))..))))...
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