RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_01494

RNA: CRW_01494
Rfam family: 5S_rRNA

			UGGUACGGCGGUCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAUCCCGAACUCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUGCCCCGAGUACUGCCAUCUGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCAC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................((((((.......((((.............))))........)))))).(((.....((.....((((((..)))))).....))....)))..........
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((....((((((((((.................................)))))))))).............(((((....)))))............))))))).....
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...(((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....(((((....)))))....)).))...)))))))..)).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.((.((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).)).))(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))).
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((....(((((((.((...((((((.(.......)...))))..))...))))))).))(.((((((.....(((((....)))))....)))))).)))))))).....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...(((((...(.(((((....))))).)..)))))...))))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.((.((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).)).))(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))).
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((.......(((((((................(((....))).......))))))).....[[[[[[....))))))..(((((((....]]]]]]...)))))))....
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...(((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....(((((....)))))....)).))...)))))))..)).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))...(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((...((((((.............))))..))...))))))).))...(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))).
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))..)))))))))))))(((((((.((((((((..)))))))))))))))..)))))))))))).
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...(((((((....((((((((....(...........(((((....)))))).....)))))).))...((.((.....((((((..))))))....)).))...)))))))..)).
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((.((((((......(((((...................(((....))).........)))))................(((((((.......)))))))........)))))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....((((((..))))))....))))))..))))))))))).
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.(((((((....((((((((...((..((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))..
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.....((((((((.......((((.............))))........)))))).)).............(..(((..)))..).............)))))).....
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...(((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.(((((....))))).)..))))).).)))))))..)).
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(...(((((((....(((((((((...)((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((.....(((((....)))))....)))))..))))))))..)..
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...(((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.(((((....)))))..).))))).).)))))))..)).
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(...(((((((....(((((((((...)((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((.....(((((....)))))....)))))..))))))))..)..
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(...((((((.....(((((((((...)((((((...(.....)...))))..))....)))))).))...(((((.....(((((....)))))....)))))....))))))..)..
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((......((((((..................(((....)))........))))))................(((((....)))))............))))))).....
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((....((((((((.......((((.............))))........)))))).)).............(..((....))..)............))))))).....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.((.((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).)).))(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))(.((((((.....(((((....)))))....)))))).)))))))))))).
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((.(((.((((((((((..(((((((.......)))))))..)).).)))))))).)).))((((((..((((((....)))))).))))))....))))))))))).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(........((((...((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))......((.....(((((....)))))....))......)..)))....).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.(((((((....((((((((...((..((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))..
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((....((.(((((((.((..((((.............))))..))...))))))).))...(((((.....(((((....)))))....)))))...))))))))))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))).))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))..

---