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UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((....(((((((.......(((((.............)))))........))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))). |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((......(((((.......(((((.............)))))........)))))................(((((....)))))............)))))))..... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..(((((((....(((((((.((...((((((.............))))..))...))))))).))....((((.....(((((....)))))....))))....))))))).))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((....(((((.((....(((((((.......))..)))))......)))))))((((.((((((..((.(((((....)))))..)))))))).))))..))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((....(((((((.(....((((((.............))))..))....)))))).)).............(((((....)))))............)))))))..... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((.....((((.((....(((((...((...))...)))))......))))))(((((.((((((.....(((((....)))))....)))))).))))).))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(([[[[.....(((((.((....(((((((.......))..)))))......)))))))((((.((((((.....(((((....)))))....)))))).)))))).]]]].. |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((.((((((((((.((((.(((((((((((...)))))))))))...))))))))).)))))(((((((.((((((((..)))))))))))))))...))))))))))). |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((.....(((((((...(............(((((....))))).)....)))))).)...((((((.....((((((..))))))....))))))..)))))))..... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((.(((((((....(((((((.((....(((((...(.....)...)))))......))))))).))(.((((((.....(((((....)))))....)))))).))))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((......((((.........))))...)))).((((..)))).............(((((.((((((.....((((((..))))))....)))))).)))))........ |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((....(((((((.((....(((((.............)))))......))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))). |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((....(((((((.(....((((((.............))))..))....)))))).)).............((((((..))))))............)))))))..... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....(((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(.(((((....(.(((((....))))).)...)))))).)))))...))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....(((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(.(((((......(((((....))))).....))))).))))))...)).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....(((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(.(((((....(.(((((....)))))..)..)))))).)))))...))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....(((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(.(((((......(((((....))))).....))))).))))))...)).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....(((((....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).))..(((((......(((((....))))).....)))))..)))))...)).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((....(((((((.((....(((((...((...))...)))))......))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((........(((((.((....(((((.............)))))......))))))).(((.((((((.....(((((....)))))....)))))).)))))))))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((......(((((.......(((((.............)))))........))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))). |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((......(((((..........(((......(((....)))..)))....))))).....(((.....)))(((((....)))))............)))))))..... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((....(((((((.(....((((((.............))))..))....)))))).)).............((((......))))............)))))....... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((....(((((.((....(((((...((...))...)))))......))))))).(((.((((((.....(..((....))..)....)))))).)))...))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((....(((((((.((....(((((.............)))))......))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((..(((((((.((....(((((...((...))...)))))......)))))))((((.((((((.....(..((....))..)....)))))).))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.((((((((((((((((((...((..((((....(......)...))))..).)...))))).))))..(((((...(((((((..))))))).).)))))))).).)))))))). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((((....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).))(....(.(.....(((((....))))).......).).)))))))...... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((.....(((((.((....(((((.............)))))......))))))).(((.((((((.....(..((....))..)....)))))).)))....)))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((.(((((((....(((((((.((....(((((.............)))))......))))))).))..((((((.....(((((....)))))....))))))..)))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((....(((((((.((....(((((...((...))...)))))......))))))).))..((((((.....(..((....))..)....))))))..))))))))))). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((......))).....(((((.((....(((((.............)))))......))))))).(((..(((((.....(((((....)))))....)))))..))).......... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((......)))).((((((((.((....(((((.............)))))......)))))))........(((.....(((((....)))))....)))[[[[.))).....]]]] |