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GAUCUGGCAGCCAUAGCGGCAGGUGUAAUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUGCCUGUACUGAAGUGUGCGAGCUUCGGGAACUCUGGAUCGUGCCAUAUCAGU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((.(....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((..(....)))))))))..))))))).))))))))))...
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(.(((((.(((..(((((((((...(((((((.............))))..)))..))))).))))((((((.((.(((((......))))).))...))))))..)))....))))).....)) |
|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((.(.....((((((((.......((((.............))))........)))))).))..(((..(......(((((..((....))))))).....).)))).))........... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((.(((..(((((((((...(((((((.............))))..)))..))))))).))((((((...((((((......)))).))....))))))..)))....))))).)))... |
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Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................... |
|
Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((.....(((((((((...(((((((.............))))..)))..))))))).)).....)))))....(((((((......))))))).................).)))... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((.((....))(((((((......((((.............)))).......))))))).(((.(((..(....(.(((((((......))))))).)..)..))).))))))).)))... |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((.....(((((((((.(.(((((((.............))))..)))).))))))).)).....)))))....(((((((......))))))).................).)))... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((.(((....(((((((...(((((((.............))))..)))..)))))))...((((((....(((((......)))))......))))))..)))....))))).)))... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((.....(((((((((...(((((((.............))))..)))..))))).)))).....)))))...(((((.((((((((..((((((...))))))))))).))).))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
|
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[ sec struct ] |
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|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
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(...(((((((....((((((((....(..((((.............))))..).....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))).).... |
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MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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McQFold
|
[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(seed)
|
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|
PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
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...((((((.(....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))(...(((((.....(((((..((....)))))))....))))).).)))))))...... |
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PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.(....((((((((.....((((((.(.......)...))))..))....)))))).))(...(((((.....(((((..((....)))))))....))))).).)))))))...... |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((.......(((((((......((((.............)))).......)))))))........)))))...(((((...((((((..((((((...))))))))))))....))))) |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((........(((((((......((((.............)))).......))))))).....(((.........((((((........)))))).......)))...)))))....... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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....(((((......((((((((.......((((.............))))........)))))).))..............(((((..((....))))))).............)))))....... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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RNAshapes
|
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(.(((((.(....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).))...((.........(((((..((....))))))).......))...)))))).....). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((.(((..(((((((((...(((((((.............))))..)))..)))))).)))((((((.((.(((((......))))).))...))))))..)))....))))).)))... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((......(((((((((......((((.............)))).......))))))).))..(((.........(((((((......))))))).......)))...))))).)))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((.(((..(((((((((...(((((((.............))))..)))..))))))).))((((((.((..((((......))))..))...))))))..)))....))))).)))... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((......((((((((......))))).........((((...((((......))))....))))..))).(((((......)))))...(((((.....)))))...)))))....... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((......((((((((......)))))................((((......)))).)))[[[[[[)))).((((.(((((......)))))))))]].(((....]]]].....))). |