|
|
|
UUAAGGCGGCCAUCGCGGCGGGGUUCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCUGCCUGCGUAUUGGUGAGUACUGGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGAGCCGAUUCGCCGCCCCUACU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
....((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))......
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(...((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....(..(((.((....)))))..)....))))))..)))))).....) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((...(..(...(((......))).......(.(((....))).))..)..)).)))..((..((........((((((.((....)))))))).......))..))........... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...((((((.(((((..((((((.............))))..))..)))))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((......((((((....................................))))))................((((((.........))))))............))))))...... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...))))))..))). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.((..(((((((((.(((((.((((.((((.((....)).......................)))).)))).))))...)..)))))........))))))..))))))...... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((....((((((((....((.((((.............)))).)).....)))))).))(.((((((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))))...... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.((..(((((((((((((((.((((.(((((((....))).((......))...........)))).)))).))))...).))))))........))))))..))))))...... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.......((((((....)))))).......(((....)))...........(((...[[[[[))).]]]]]...{{{{{{...(((...)))...........))))))}}}}}} |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...))))))..))). |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.......((((.............))))........)))))).))).((((((.....((((((.........))))))....))))))..))))))...... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....(..(((.((....)))))..)....))))))..))))))...... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.......((((.............))))........)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))).)))))))))).))))((((((((.((((((((.(((..))))))))))))))))))))))))))))..... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((...........(....(((((....))))).....))))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...))))))..))). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((..................(((((....))))).......))))).))....((.......((((((((.....)))))))).......).)..)))))))))... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.......((((.....[[[[....))))........)))))).))).((((((.....((((((.]]]]....))))))....))))))..))))))...... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.((((((...(((((((((.......((((.............))))........)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))..)).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((....((((((((.......((((.............))))........)))))).)).............(..(((((.....)))))..)............))))))...... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....)))))))).)..))))).).))))))..))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..)))))))..))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....))))))))..).))))).).))))))..))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..)))))))..))). |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..((((......((((((.((....)))))))).....))))..)))))))..))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.......((((.............))))........)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.((((..((((((....)))))).....(((((...............(((((....(((((....)))))....)))))........)))))....))))..))))))...... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((......((((((..................(((....)))........))))))................((((((.........))))))............))))))...... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((....((((((((.......((((.............))))........)))))).)).............(..(((.((....)))))..)............))))))...... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....(..(((.((....)))))..)....))))))..))))))...... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))..)).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....(..(((.((....)))))..)....))))))..))))))...... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((..((((((((((((((.(((((((..(...)(..((((...)).)).)(((......)))))))))).)))).))))).))(((...)))).)))))).))))))...... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(..((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))...........(.(((((..((....)).)))))...)........)))))..).).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....(..(((.((....)))))..)....))))))..))))))...... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((....((.((((.............)))).)).....)))))).))).((((((.....((((((.((....))))))))....))))))..))))))...... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...(((((((((.((.((.((((.............)))).))..)).)))))).))).((((((.....(..(((.((....)))))..)....))))))..))))))...... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.....((((.((((.........)))).((((..........(((..((......))..)))(((....))).(((.((....))))).))))..))))....))))))...... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.....((((.((((.........)))).((((..........(((..((......))..)))(((....))).(((.((....))))).))))..))))....))))))...... |