RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_01501

RNA: CRW_01501
Rfam family: 5S_rRNA

			GCCCCUAACCCGGCCAUAGGCGCCGGUGAUACGCCCGGUCUCAUCAGAACCCGGAAGCUAAGGCCGGCGCCGCGCUCGGGAGUACUGGGCUCCGCGAGGGCCCGGGAAACCGGCGUGCUGGGAGGGGGCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((....(((((((............))))..)))...))))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).))))))..
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((.....(.(((((((....(..((((............))))..).....))))))).).............((((((.((....))))))))....))))..................
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.....(((((((((....)))..))))..))....)))))))))(((((..((....((((((((.....))))))))....))))))))))))).))))))..
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((((((....(((((((((.......((((............))))........))))))))).............((((((((.....))))))))...........))))))))))))...
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((.....((((((............))))..))....)))))).))(((..(((.....((((((.((....))))))))....))).)))))))))....)))..
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..)))))))))((((.(((.....((((((((.....))))))))....))))))))))))).))))))..
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((....(((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))))))((((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))))))))).........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.....((((((............))))..))....)))))))))((((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))))))))).))))))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..)))))))))((((.(((.....((((((((.....))))))))....))))))))))))).))))))..
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).))))))....)))..
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.......(((((((....)))..))))........)))))))))((((.(((.....((((((.........))))))....))))))))))))).))))))..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((.((.(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..)))))))))((.(((((((((.....))))).)))).))((((....)))).)))))))).))))))..
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))).))))))..
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.....((((((.((....))...))))..))....)))))))))((((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))))))))).))))))..
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((......(((((.....(.((((((..(((..((((..((....))..))))..)).)..)))))).)..(.((((((..(.((((((.((....)))))))).).))))))).))))).....)).).
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.....((((....((((((((....(..((((...(.....)...))))..).....)))))).))((.(((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))....)))))))))..
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((.((.(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..)))))))))((.(((((((((.....))))).)))).))((((....)))).)))))))).))))))..
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.......((((............))))........)))))))))((((.(((.....((((((((.....))))))))....))))))))))))).))))))..
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((...(((((.....(((((((((.....((((((............))))..))....))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))..)))))..)))))..
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((.......((((((.....((((((............))))..))....))))))................(..((..((....)).))..)...........)))))).........
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))(((..(((...(.((((((.((....)))))))).)..))).)))))))))....)))..
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((..(((.....((((((.((....))))))))....))).)))))))))....)))..
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))(((..(((...(.((((((.((....))))))))..).))).)))))))))....)))..
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((..(((.....((((((.((....))))))))....))).)))))))))....)))..
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....((((((....((.((((((....(((((((.(......)...))))..))...))))))).)).((..(((.....(.((((.((....))))))..)...))).)).))))))....)))..
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))).))))))..
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((.((.(((((((((..((.((((((............))))..))))..)))))))))...(((((((((.....))))).))))...((((....)))).)))))))).))))))..
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.......((((............))))........)))))))))...(((((((((.....))))).))))...((((....))))...)))))).))))))..
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((......(((((((.......((((............))))........)))))))...............((((((((.....))))))))...........)))))).........
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((.......((((((.....((((((............))))..))....))))))....((...((.....(..(((.((....)))))..)....))..)).)))))).........
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))).))))))..
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((.(((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))..))))))..
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..)))))))))((((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))))))))).))))))..
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((((((...))((((((...((...(((((.(((..)))))).))....))...)))))).((((((.((.(..((((((((((...))))))))))..)))))))))))))))))))))..
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.......(.(.(....(.((((((.....((((((............))))..))....))))))....)((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))))...)......).).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..)))))))))((((.(((.....((((((.((....))))))))....))))))))))))).))))))..
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.....((((((..((....))..))))..))....))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))).))))))..
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((..((.((((((..((....))..))))..))))..))))))))).(((.(((.....((((((.((....))))))))....)))))).)))))).))))))..
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((((....(((((((((.......((((............))))........)))))))))...(((((((((.....))))).))))...((((....))))...)))))).))))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...(((((....[[[)))))........((((..((....))..)))).........(((((]]]..)).))).....((((((((.....))))))))....((((....))))..))))))..

---