|
|
|
GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))))))...
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).))))))....)) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..(((((....((((((((.....(((.....................)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))..))... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.....................)))....))))))))((((((((((...((((((.((....))))))))..)))))))))))))))).))... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((((....((((((((......(..((.............))....).....)))))))).............(((((..((....)).)))))............)))))).).... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((.............))...)))....))))))))((((((((...(.((((((.((....)))))))).)..)))))))))))))).))... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((((.......))..))...)))....))))))))((((((((((.(.((((((.((....))))))))).)))))))))))))))).))... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....))).....((((((...........[[[[...(((.......))).....))))))((((((((((((........((((.....)))).]]]])))))))))))).......... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((...[[[[[[[[..........................))).......]]]]]]]]((((((((((...((((((.........))))))..))))))))))............ |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((((.((.......)).))....)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))).))... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))).))... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((......((.((.............))...)).....))))))))((((((((((...((((((.((....))))))))..)))))))))))))))).))... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))..))))))))).((((((((.((((((((.(((..))))))))))))))))))))))))))))))... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((.......))..))))..)))...))))))))(..(((((.....((((((..(.....)))))))....))).).)))))))))))... |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.....................)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))).))... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((..................(((..[[[[.))).....))))))))((((((((((...((((((....]]]].))))))..))))))))))))))))...... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))))).((((((....(.((((((.((....)))))))).)...)))))).)))))))))... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))))).((((((....(.((((((.((....))))))))..)..)))))).)))))))))... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))).))... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.(..((((((((.....(((.....................)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))))))))))...... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........((((((((((((.........)))).(((((..((((.((((..........((((...))))..........))))))))....))))).........))))))))..... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))).))... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..(((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))..))... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....))))))))((((((((((...((((((.((....))))))))..)))))))))))))))).))... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((...((((((((......((.((((((........)))....(......).))).))..((((((((.(.(((((((.((...).)))))))).))))))))))))))))))))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((....................................))))))))((((((((((...((((((.((....))))))))..)))))))))))))))).))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((.....(((.((......))((....))..)))....)))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).)))))).))... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....(((((.((((.........))))......((((....))))..)).))).((((...(((......))).((((.....))))......)))).....))))))...... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....(((((((((((.............)))).((((....))))....))))))).(((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))).))))))...... |
