|
|
|
ACAUACGGCCAUAGAUUGAAGAAUAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUUCUAAUCGCCAAGUUAGUACUGCGGUGGGUGACCACGCGGGAAUCCUUGGUGCUGUAUGU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((............)))).))......)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((....(((.((((.......((((............)))).........)))).).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))...... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))...))....)))).))))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...................((((............))))..............................(((((.(((....))))))))...........))))))))) |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............)))).........)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((..........((((....)))).........................)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((.((((.......((((............)))).........)))).).))(((((.......((((.((((....))))))))......)))))))))))))) |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((........((((.....((((((............))))...))....)))).....((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....(((((())))))...................)))).))))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((....................(((({{{{{{.(((..))))............((((.[[[[[[[))))....)))((((....))))}}}}}}...]]]]]]]))))))). |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))...))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((....))))..(((.......)))....)))).))))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((............)))).))......)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((...(....)...)))).))......)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............)))).........)))).))))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((((.....(((((((..(((..(((((..(....))..))))...)))...)))))).)..((((((.....((((.((((....))))))))....)))))).)))))))). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((...(....)...))))...))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............)))).........)))).)))).(((((......((((.((((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.........((((.....(((((..)))))...................))))....(((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((............)))).))......)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((....((((((((.......((((............)))).........)))))).))(((((.......(((((.(((....))))))))......)))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))...))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))) |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))...))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))...))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))) |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))...))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))...))....)))))).)))((((....(..(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((............)))).))......)))).)))).(((((......((((.((((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............)))).........)))).))))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.................((((....))))......((((.((((..(((((.........)))))...))))..((((....))))..)))).........))))))))) |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((........((((.......((((............)))).........)))).....((((((............(((....)))..........))))))))))))))) |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............)))).........)))))).))(((((.......(((((.(((....))))))))......)))))))))))))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((...(....)...)))).))......)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((.(((....((((....))))....)))....))))).............(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((...(....)...)))).))......)))).))))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((((........))...(((((..((((..(..(..((((((((..((...(((..........)))..))))))))))..)..)..))))...))).)))))))))))) |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((.((((...((..((((............))))...))....)))).).))((((((.(....(((((.(((....)))))))).)...))))))))))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....................................)))).))))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))) |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....((((((((.......((((............)))).........)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((.((((............)))).))......)))).)))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.................((((....))))..............(((((...(((((......)))))..(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.................((((....))))..............(((((...(((((......)))))..(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) |