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GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))..)))).)).) |
|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))((((((.............((....))...........))))))........... |
|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((....(((....)))...))....)))))))..))))).... |
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Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((.(((....))))).))..)))))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((........((((((.......((((............))))........))))))...(((((((...........(((....))).........)))))))..))))).... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))..))))).... |
|
MCFold
(ext)
|
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
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Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............((((((...((..((((............))))..))....))))))((((((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))).)))....... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))).. |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PPfold(20)
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[ FASTA input ] |
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PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((((..(((....)))..)))).)))))))))..))))).... |
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ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((.......((((((((..(((..((((............))))..)).)..)))))).)).((((((.....(((((.(((....))))).)))...))))))[[[[)))]]]]. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.......(((((........((((..(((((((((..(((((.........((((...))))..)))))..))))))))).......)))).......))))).))))).... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((........((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((............)))))...)))))))..))))).... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))).)))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))..))))).).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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((((.........((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((..((.((((..(((....)))..)))).))))))))))))........ |
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))..))))).).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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.((((((.(((..(((((((((((((..((((((......))..))))..))))).))))))..))(((((................((.((.......))))))))))))))))).).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((.(....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...(..((.((.(((....))))).))...).))))))).))))).).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))..))))).).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))...))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((..(..((....))..)..)).)))))))))..))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.........))))).........((((((.(((((..(((((......((........))....)))))..)))))..(((....))).))))))......(((.....))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.........))))).......((((...[[[[[[[[.))))............]]]]]]]]....((((.(((((..((....))..)))))...)))).((((.....)))) |