|
|
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((....(((....)))...(((((((......(((((((..(((((....)))))))).))))......((((.((....))))))))))..)))..))))))))..))) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))..(((..............((....))............)))............. |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((((......))..)))).........))))).))(((((.......((((((.((....))))))))......)))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...................((((............)))).............................................................))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((..((....)).)))))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((......((((((............))))..)).....))))).)).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))(((((.((....((((((.((....))))))))...).))))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((.[[[[[......)))).........]]]]]...{{{{{.......{{{{{))))).(((..}}}}}...)))}}}}}))))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..))))...)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).))).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).)))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.......((((((.((....))))))))......)))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.(((((((((....))))))))).)))))))).))))))))).. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((...(....)...))))..))....)))))).))(((((((...(.((.((.(((....)))))..)).).)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((................((((((...(((((((..((((((..))))))))).))))........)))))).......))))...........))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((((......))..)))).........)))).))).(((((......((((((.((....))))))))....).)))).))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))....................(....)..................))))))).... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((((......))..)))).........))))).)).(((((......(...(..((....)).)....)....))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((....(((....)))...(((((((......(((((((...((((....)))).))).))))......((((.((....))))))))))..)))..))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((............)))).........))))).))((((((.(....((((((.((....))))))))...)).)))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((............)))).........)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((............)))).........)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.......(((((((........((((((......))..)))).........))))).))...((((........((..((....))..))......))))......)))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((....(((....)))...(((((((......(((((((...((((....)))).))).))))......((((.((....))))))))))..)))..))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).))).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((.........(((((......))..)))((......))))))).))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((..((((.((((((((......))))))).)))))...))))).))(((((.((((.((((((..(((...))))))))).))))))))).)))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).((.(.(.....(((((..((....)).))))).....)).)).))))))).)). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....((.((((........((((............)))).........))))..))(((((.......((((((.((....))))))))......))))).)))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).)))(((((..(....((((((.((....))))))))...)..)))))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..........)))))..((((.((((............))))....((((....)))).(((((.......((((((.((....))))))))......)))))..))))..... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..........)))))..((((.((((............))))....((((....)))).(((((.......((((((.((....))))))))......)))))..))))..... |