|
|
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((....(((....)))...(((((((......(((((((..(((((....)))))))).))))......((((.((....))))))))))..)))..))))))))..))) |
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))..(((..............((....))............)))............. |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((((......))..)))).........))))).))(((((.......((((((.((....))))))))......)))))))))))))).. |
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...................((((............)))).............................................................))))))))).. |
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((..((....)).)))))....)))))))))))))))).. |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((......((((((............))))..)).....))))).)).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))(((((.((....((((((.((....))))))))...).))))))))))))))).. |
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((.[[[[[......)))).........]]]]]...{{{{{.......{{{{{))))).(((..}}}}}...)))}}}}}))))))))).. |
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..))))...)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))).. |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).))).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).)))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.......((((((.((....))))))))......)))))))))))))).. |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.(((((((((....))))))))).)))))))).))))))))).. |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((...(....)...))))..))....)))))).))(((((((...(.((.((.(((....)))))..)).).)))))))))))))))).. |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((................((((((...(((((((..((((((..))))))))).))))........)))))).......))))...........))))))))).. |
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((((......))..)))).........)))).))).(((((......((((((.((....))))))))....).)))).))))))))).. |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))....................(....)..................))))))).... |
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((((......))..)))).........))))).)).(((((......(...(..((....)).)....)....))))).))))))))).. |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((....(((....)))...(((((((......(((((((...((((....)))).))).))))......((((.((....))))))))))..)))..))))))))))).. |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((........((((............)))).........))))).))((((((.(....((((((.((....))))))))...)).)))))))))))))).. |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((............)))).........)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))).. |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((............)))).........)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))).. |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.......(((((((........((((((......))..)))).........))))).))...((((........((..((....))..))......))))......)))))).. |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((....(((....)))...(((((((......(((((((...((((....)))).))).))))......((((.((....))))))))))..)))..))))))))))).. |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).))).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((.........(((((......))..)))((......))))))).))(((((.(.....((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((..((((.((((((((......))))))).)))))...))))).))(((((.((((.((((((..(((...))))))))).))))))))).)))))))).. |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).((.(.(.....(((((..((....)).))))).....)).)).))))))).)). |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....((.((((........((((............)))).........))))..))(((((.......((((((.((....))))))))......))))).)))))))).. |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).((((.......((((((.((....))))))))......)))).))))))))).. |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....)))).)))(((((..(....((((((.((....))))))))...)..)))))))))))))).. |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..........)))))..((((.((((............))))....((((....)))).(((((.......((((((.((....))))))))......)))))..))))..... |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..........)))))..((((.((((............))))....((((....)))).(((((.......((((((.((....))))))))......)))))..))))..... |