|
|
|
GGCGUACGGCCAUACUACCGGGAAUACACCUGAACCCGUUCGAUUUCAGAAGUUAAGCCUGGUCAGGCCCAGUUAGUACUGAGGUGGGCGACCACUUGGGAACACUGGGUGCUGUACGCUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((...((..(((((..........)))))..))....))))))...(((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))))))))))))).) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((....((((((((...((..((((...(....)...))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...))))))))))........ |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((.....(((((((..........)))))..))....))))))...(((((((.....((.((((((....))))))))....))))))))))))))))). |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((...................................))))))...(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))). |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..........)))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((..(((((....))))).)).....))))).)))))))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..(....)..)))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((.......(((((..........)))))........))))))...(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))). |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((.......(((((..........)))))........))))))...(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))). |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..........)))))..))....)))))).)).((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))).)))))))))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..(....)..)))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..........)))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))).))))))).)). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....((..(((((..(....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..........)))))..))....)))))).)).((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))).)))))))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((.......(((((..........)))))........))))))...(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))). |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((.......(((((..........)))))........)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))))))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((...((..(((((..........)))))..))....))))))...(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((..(((..(((((..........)))))..)).)..)))))).))(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((.......(((((..........)))))........))))))...(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))). |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((......((((((.....((((((............))))..))....))))))....(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((...((..(((((..(....)..)))))..))....))))))...(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..........)))))..))....)))))).)).((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))).)))))))))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..(....)..)))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((.((.(((...)))....(((((((......)))))))).)...((((((..))))))(((......))).((((.((.((((..))))))))))...))))))))))). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((....(.(((.((...((..((((.(......)...))))..))....)).)))..)((((((...(..(((((.(((....))))))))...).))))))))))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..(((((..(....)..)))))..))....)))))).))(((((((..((.((.((((((....)))))).)).))))))))))))))))))). |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).)).((((((..((.((.((((((....)))))).)).)))))))).)))))))))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((......((((((...((..(((((..........)))))..))....))))))...(((((((..((.(..((((((....))))))..).))))))))))))))))))). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((........((((......))))..(((....((((.....))))..((((....)))).((((....)))).(((((....))))).)))..........)))))))))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.((.....((((.......[[[[.))))...((((]]]].))))..((((....)))).((((....))))..((((....)))).(((.....))).)))))))))))). |