|
|
|
GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGGGCCUGCCCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACAGCAGGUGUUGUAGACUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))....((............(((....)))..........))............... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((((((((((....))))).....)))).....))))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((................................))))))))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((.......((.((.(((....))))).))......)))).))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((((.......((((.[[[[[[[[[..))))........)))))).(((....))).....]]]]]]]]]....((((((.......)))))))))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((.......((((.(((....))).)))).....))))))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)).(((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))).))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))).)))))))(((((..)))))(((((((((((((..))))))))))))))))))).))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.(((((.(((....))))))))..)))))))).))))))))).. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)).(((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))).))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...................((((((((((((((.....................((((..)))).....))))))))).)))))((((.......)))).))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((.((((....((..((((............))))..)).....))))..))((((........((.((..((....)).)).)).......))))))))))).)). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).)))(((((......(((((...((...)).))))).....))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((((((...)))).(((((....)))))......))))))))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((................................))))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))((((((......((.((..((....)).)).)).....))))))))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).(((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))).))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((.(.(.(((((((.(((..((((((......))..))))..))).).)))))))))).(.((((...((..))..)))))((.(((((.((..)))))))))))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).)).(.(((......((.((...((...)).)).)).....))))..)))))))..). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((((.......((((............))))........)))))).......(((((.........)))))....(((((.......))))).)))))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......[[[[....((((.....(((.(((....)))))).))))..[[[[[..)))))).]]]]].]]]]((((.......)))).))))))))).. |