|
|
|
GCCUGCGGCCAUACCACGUUGAAUGCACCGGUUCCCAUCUGAACACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCAGCUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUCGCUGGUGCUGCAGGCUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))...((..........((..((....)).)).........)).............. |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...................................))))))...((((((................................))))))))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(..((((............))))..).....)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((....(.(((((.(((....))).))))).)..))))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......[[[[[[[[[...................))))))...(((((.....(((((....)))))......]]]]]]]]])))))))))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...(..(((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((..((....)).)).)).....))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)).(((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))).))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))))))).. |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((.(..(((((((((((..)))))))))..))..)))))))))).((((((.(((((((((((.(((..))))))))))))))))))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).)).((((((..((.(((((.(((....))))))))..)))))))).))))))))).. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....)))))).))...)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)).(((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))).))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...((((............(((((((((........((((............)))).((((........))))...((((..))))))))))))).))))))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.......((.((...(....)..)).))......)))))))))))))... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).))((((((......((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((((((.((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((......((((((.(......)...))))..)).....))))).)).(((((......((((((..((...)))))))).....))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)).)..)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((......(((((............)))))....))))))))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...................................))))))...((((((......(((((............)))))....))))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).)).((((.......((.((..((....)).)).))......)))).))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....))))))..))(((((...((.(((((.(((....))).))))).)).))))).))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...((.((..(.(((....))).)..)).)).))))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((........))....((((((((((((.((..)).(((((((((..)))))))))..(((........))).(((((...)))))))))))...)))))))))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).)).(((((.(....((.((...((...)).)).)).)...))))).))))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((..(.(((....))).)..))....))))))))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((..(((.......))).((((.........((((............)))).((((........))))...(((....))).)))).....))).))))))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.......(((((.........((((......)))).[[[[.......)))))]]]].((((((((.....)))..((((....)))).......))))).))))))))).. |