|
|
|
GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......)))))).))).((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))).)))))))..)) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((....((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))((.((((.....((....(((....)))....))...)))).)))))........ |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((....((((((..((....))..))))..))...))))))).))(((((((..((.(((((.(((....))))).))).)))))))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((......((((............)))).......)))))))...(((((((..............................)))))))))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............))))........)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))).)))...)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((.....(((((..((....))..))))..)....))))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((....((((((..((....))..))))..))...))))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........(((((((......((((.{{{{{{{{...)))).......}}}}}}}.[[[[[[[[[.......})))))))...............]]]]]]]]]))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((......((((............)))).......)))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....)))))))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((..((..((((..((....))..))))..))...)))))).))).((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))).))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......)))))).))).((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))).))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((............)))).......))))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))))))))))).. |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))).)))))).))(((((((..(((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.(((((((((....))))))))).)))))))))))))))))).. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((..(((((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......))))))).)).((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))).))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........(((((((......((((..(((..)))..)))).......))))))).(((((((((...((((((..)))))).............)))))))))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((..((..((((..((....))..))))..))...)))))).))).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((....((((((((.......((((...(....)...))))........)))))).))((((........((.((.(((....))))).)).......))))))))))).... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).)))(((((......(((((..((....)).))))).....))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......))))))).)).((((((..((.((((..(((....)))..)))).)))))))).))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((............)))).......))))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((......((((............)))).......))))))).....(((((((.............)))))))...............))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((...........(((....))).........)))))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((...(....)...))))........))))))....(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......)))))).))).((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))).))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((.......(((..((....))..)))........)))))).))).((((((..((.((((..(((....)))..)))).)))))))).))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......))))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((......((((((..)))((((((......))..)))).)))((..(((.((.(((.......))))))))..))((((.((.......))))))...)))))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)....(((.(....((.((.(((....))))).)).)...)))...))))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......))))))).))(((((((..((.((..(.(((....))).)..)).)))))))))))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......))))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((......((((..((....))..)))).......)))))).))).((((((..((.((..(..((....))..)..)).)))))))).))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((....))))......((((............))))...((((((....(((....)))....(((((....)))))...))))))...........))))))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..((((....))))......((((............))))...((((((.(((..[[[)))......(((((....)))))...))))))........]]].)))))))).. |