|
|
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))...
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))......... |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))))))... |
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((((((....)))))))))...))))))))))))))))... |
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....))))))))))))))))... |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))... |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..(((.((......))...)))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))... |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).)))))))))... |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).))))))))))))))))))... |
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((........(((.......(((((((((..((((....))))..[[[[[..)))))))))..........]]]]]..)))....(((((((.....)))))))))))))))... |
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....))))))))))))))))... |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))... |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..))))))))))))))))... |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))... |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((((..))))))))))))))..)))))))))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))... |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.(((((.(((....))))))))..)))))))).)))))))))... |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((...(....)...))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....)))))).))...))))))))))))))))... |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((..........(((((((((..(((((..))))).........))))))))).))))..........)))).....(((((((.....)))))))))))))))... |
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.......((.((.(((....))))).))......))))))))))))).... |
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...)))))))))))))))... |
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))... |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..)))))))))))))))... |
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))... |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).)))((((.......(((((..((....)).)))))......)))).)))))))))... |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))))))... |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............))))........)))))).))(((((((.(.(....((.(((....))))).....))))))))))))))))))... |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..........((((....(((((((((..((((....)))).........)))))))))....))))................(((((((.....)))))))))))))))... |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((............)))))...))))))))))))))))... |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.......((.((.(((....))))).))......))))))))))))))... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..))))))))))))))))... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((......((.((((......))))..))........)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))))))... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(.(((((.(((........((((((......))))..))(((((((((((((...).)))))))))))).))).))))))..(((((.(((..))))))))))))))))... |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))).)..). |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((..(.(((....))).)..))...))))))))))))))))... |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((..(..((....))..)..))...))))))))))))))))... |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..................(((.((((..((((....)))).((((..((((......))))..))))....))))))).....((((((.....)))))))))))))))... |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.................(((((((((..((((....)))).[[[.....)))))))))..((((]]]............)))).(((((.....))))).)))))))))... |