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GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).............
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....)))))))))................... |
|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))..((((((........)))))).(((.(((((((...))))))))))............))))).. |
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Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............((((((...................................))))))...((((((......(((((((((....)))))))))....))))))...................... |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))............. |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))).)))............. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))).)))............. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..((((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...)))))...............(((.((((((((.))))))))))))..)))............. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))))............. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((....((((((..(((..((((.....[[[[[[[))))..)))...))))))......)))))........]]]]]]]....(((((((...)))))))...................... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....))))).))).((.(((....))).))..((....)).((((((...)))))).))))).)))............. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((...))).((((((.(((((((((((((((((((...(((((...(((((((((((((((...)))))))))).))))))))))))))))))(((((...))))))))))))))))......)))))). |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.(((((((((....))))))))).)))))))).)))))))))............. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.((.((.(((....))).)).)).))))))))))))))))))............. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((.(((....))).))...(....).(((((((...)))))))))))..)))............. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((.........))))))....((((((.....(((((((...(((((........................)))))))))))).....((((((...))))))))))))................. |
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Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))).)))............. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....((((((((...((..(((.((......))...)))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))).............. |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...)))))))))))))))............. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))............. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..)))))))))))))))............. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))............. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((..((....)).))))).....))))).)))))))))............. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((..((....))..))))).)).))))))))))).)))............. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))....(((....))).............(((((((...)))))))))))).)))............. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((.........))))))....((((....))))((((..((((...................((((((........)))))).....(((((((...)))))))......))))....)))).... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((............(((....)))..........)))))))))))................. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...((..((((((......))..))))..))....))))))...((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))))............. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.(((((..((....))..))))).)).))))))))))).)))............. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(.(((...(((((((((.(((..(((((((((..)))))))))..))).).)))))).))....))).....((........))((.(((((((...))))))))).).))))............. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...(..((.((.(((....))))).))...).))))))))))).)))............. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((......((..(..((....))..)..))....))))))))))).)))............. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))).)))............. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((.((((........)))).....((((....)))).)))...(((...((((......))))..((((((........)))))).))).((((((.....))))))......(((........))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((.........))))))....((((....))))(((((....[[[[[........)))))..((((((...]]]]])))))).((((.(((((.....)))))))))..((((........)))). |