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GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU |
Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).............
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))..((((((........)))))).(((.(((((((...))))))))))............))))).. |
Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))............. |
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))).)))............. |
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))).)))............. |
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..((((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...)))))...............(((.((((((((.))))))))))))..)))............. |
DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))))............. |
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....))))).))).((.(((....))).))..((....)).((((((...)))))).))))).)))............. |
HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((...))).((((((.(((((((((((((((((((...(((((...(((((((((((((((...)))))))))).))))))))))))))))))(((((...))))))))))))))))......)))))). |
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.(((((((((....))))))))).)))))))).)))))))))............. |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.((.((.(((....))).)).)).))))))))))))))))))............. |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
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(((.(((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))).)))............. |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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NanoFolder
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...)))))))))))))))............. |
PETfold_2.0(20)
|
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(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))............. |
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..)))))))))))))))............. |
PETfold_pre2.0(20)
|
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(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))............. |
PPfold(20)
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((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((..((....)).))))).....))))).)))))))))............. |
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.(((((..((....))..))))).)).))))))))))).)))............. |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))....(((....))).............(((((((...)))))))))))).)))............. |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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.((((((.........))))))....((((....))))((((..((((...................((((((........)))))).....(((((((...)))))))......))))....)))).... |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((............(((....)))..........)))))))))))................. |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((......((((((...((..((((((......))..))))..))....))))))...((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))))............. |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.(((((..((....))..))))).)).))))))))))).)))............. |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(.(((...(((((((((.(((..(((((((((..)))))))))..))).).)))))).))....))).....((........))((.(((((((...))))))))).).))))............. |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((...(..((.((.(((....))))).))...).))))))))))).)))............. |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))((((((......((..(..((....))..)..))....))))))))))).)))............. |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))).)))............. |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))).)))((((((...((.((..(..((....))..)..)).)).))))))))))).)))............. |
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((.((((........)))).....((((....)))).)))...(((...((((......))))..((((((........)))))).))).((((((.....))))))......(((........))).. |
Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((.........))))))....((((....))))(((((....[[[[[........)))))..((((((...]]]]])))))).((((.(((((.....)))))))))..((((........)))). |