|
|
|
GCCUACGGCCAUACUACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCUGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGGUUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((....((((((((.......((((............))))........)))))).))((((((............(((....)))..........)))))))))........ |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.....((((((..((....))..))))..))....))))))...(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((((((....)))))))))...)))))))))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(.((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).).(((((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.....((((((............))))..))....))))))....(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(.((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).).(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((((.....{{{{(..{{{{{{{{{...(((........)))))))))..)}}}}......}}}}}}}}}....(((((((.....))))))))))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....)))))))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((........))....((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))...((((((.....))))))))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((................((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))...((((((.....))))))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...(((((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))))))))))))).. |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((((((((((.((((((((((((((..))))))))))))))..)))))))))))((((((((.((((((((.(((..))))))))))))))))))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)).((((((..((.(((.(((((....)))))).)).)))))))).))))))))).. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((........))....((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))...((((((.....))))))))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....((((((.......((((............))))........))))))..)))).....(((((((((.((((((..))))))......))))))))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((.......((.((.(((....))))).))......)))))))))))))... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).)))((((.......(((((..((....)).)))))......)))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((................((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))...((((((.....))))))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((...))))....((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))...((((((.....))))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.................((((.........(((((((((((............))))...)))))))..........))))..(((((((.....))))))))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((...........(((....))).........)))))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...((..((((((......))..))))..))....))))))...(((((.......((.((.(((....))))).))......)))))))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((................((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))...((((((.....))))))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((................((((.((((..(((((((((((((.(((....))).))))...))))))).))..)))).))))....(((((.....))))).))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((....(((((((.(((..((((((......))..))))..))).).))))))(((((((...............))))..)))((((((...)))))))))))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))))).). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...(((((((.....((..(.(((....))).)..))...)))))))))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...))))))...(((((((.....((..(..((....))..)..))...)))))))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((.((((.......((((............))))........)))).(((....))).))).((((....))))....((((((.....))))))))))))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.......(((((....[[[[((((.......)))).[[[[.......)))))]]]]..(((((....)).)))...]]]]...((((((.....))))))))))))))).. |