|
|
|
GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..)))))))).)))))..)) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).(((((................................)))))............ |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))..))))).... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((........((((((.......((((............))))........))))))...(((((((..............................)))))))..))))).... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))))).))))).... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))))).))))).).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).).))))).... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((...(.(((((.(((....))).))))).).)))))))).))))).... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((........((((((.......((((.[[[[[[[[[..))))........))))))................]]]]]]]]]....(((((((.....))))))).))))).... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))).)). |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((.(((..[[[[........)))....((((((.(((............))))))))).]]]].......))))))((((((.((((((.....))))))))))))..... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((((...((((..(((....)))...((((((.(((.((......)).))))))))).))))..)))..)))))).(((((.((((((.....)))))))))))...... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..)))))))).))))).... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))))..))))).... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...(((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))).))))))))))(((((((((.((((((((.(((..))))))))))))))))))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.(((((.(((....)))))).)).)))))))))))))))).)). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....)))))..))...)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((.((...((((..(((....)))...((((((.(((.((......)).))))))))).))))..))...)))))).((((.(((((((.....)))))))))))...... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((........((((((.......((((..(((..)))..))))........))))))...(((((((...........((((((..)))))).....)))))))..))))).... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))..))))).... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))).)))... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))((((.......(((((..((....)).)))))......)))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))..))))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((((...((((..(((....)))...((((((.(((............))))))))).))))..)))..))))))(((((.(((((((.....))))))))))))..... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((......((((.......))))....(((((((.................)))))))............))))))(((((.(((((((.....))))))))))))..... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((........((((((.......((((............))))........))))))...(((((((..............................)))))))..))))).... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)).((((.......((.((.(((....))))).))......)))).))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..)))))))).))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((......((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))..))))..... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))).))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((.(((..(((((((((.(((.(((((((......))..)))).)))).).))))))..))(((((.((..((((((.(.((...)))))))))..))))))))))))))).).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(...(.((.....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))...)...). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((..(.(((....))).)..))...)))))))).))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))...))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((......((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((..(..((....))..)..))...)))))))..))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((....((((..((((.......))))....(((((((.((.((......)).)))))))))((((.......))))...))))..(((((((.....))))))).))))).... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(((......((((.......))))....(((((((.((.((......)).)))))))))(((((....)).))).))).....(((((((.....))))))).))))).... |