RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_01608

RNA: CRW_01608
Rfam family: 5S_rRNA

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))............
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((.....((((((..(((..((((............))))..)))...))))))((((((.....))).))).)))).(((...(((((((...)))))))....)))..........))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))((((((......(((..((((....)))).))).....)))))).....................
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((.((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((....))))))....)))...(((((((...)))))))..)))))))............
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((...................................))))))...((((((......(((.(((((....)))))))).....))))))..)))))))............
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))............
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(......((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))))....(((((......((((.((((....)))))))).....))))).).)))))))............
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(....((((((((..(((..((((((......)))..)))..)))...)))))).))((((((...(..(((.(((((....))))))))...).))))))).)))))))............
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(.........((((((.....((((((............))))..))....))))))...............(((((.(((....)))))))))..))).(((((...............)))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).))(((((((....)((((.((((....))))))))(...)))))))).)))))))............
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((.......((((............))))........))))))....((((((....))))))..........(((((((...)))))))..)))))))............
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))).............
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((..(((..((((.....[[[[[..))))..)))...))))))....((((((....))))))((((....))))]]]]]............)))))))............
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......((((((((...((..((((............))))..))....)))))).)).((((((....))))))(((...))).(((((((...)))))))..)))))))............
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((..(((..((((...(....)...))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))..)))))))............
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((...((..((((............))))..))....))))))...((((((......((((.((((....)))))))).....))))))..)))))))............
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).)).((((((..((.((((.((((....))))))))..)))))))).)))))))))............
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))...........)).))(((((((...(.(((.(((((....)))))).)).).)))))))))))))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((...((..((((((......))..))))..))....))))))..(.((((((....))))))..).......(((((((...)))))))..)))))))............
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((.......(((([[[[[.......))))........))))))((((((((((....))))))((((....)))).]]]]]..)))).....)))))))............
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((...((..((((............))))..))....))))))...((((((...((.(((((.(((....))))))))..)).))))))..)))))))............
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((....(((((((....((..(((..............)))..)).....))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))))))))))..............
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...)))))))))))))))............
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..)))))))))))))))............
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))............
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((...((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))....(((((.(((((....))))).))))).)).......[[[[[.))))))).......]]]]]
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......((((((((..(((..((((............))))..)))...)))))).))(((((((....)))))).)........(((((((...)))))))..)))))))............
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((.......((((............))))........))))))....((((((....))))))..........(((((((...)))))))..)))))))............
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((.......((((............))))........))))))...((((((............(((....)))..........))))))..)))))))............
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....)))))).))))))))............
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))..)))))))............
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.........(((((..(((..((((............))))..)))...))))).((((....(((....(((((.(((....)))))))).))))))).....)))))))............
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((....)))((((.(((..(((((((......)))))))..))).).))).(((.(((((((......))).)))).)))(...((((((..))).)))..))))))))............
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......((.(((((...((..((((............))))..))....)))))..))((((((.(....(((((.(((....)))))))).)...))))))..)))))))............
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((..(((..((((............))))..)))...))))))......(((......)))............((((((.....))))))..)))))))............
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((...((..((((............))))..))....))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))..)))))))............
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))..)))))))............
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(((.((((((.......((((............))))........))))))..((((((((....))).))))).)))...((((((.....))))))..)))))))............
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.........(((((...[[[[(((({{{{{.......))))........))))).((((..((((....)))).(((((....)))))}}}}}..)))).]]]])))))))............

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