|
|
|
ACAGCCGUUCAUACCACACGGAGAAUACCGGAUCUCGUUCGAACUCCGCAGUCAAGCCGUGUCGGGCGUGCUCAGUACUACCAUAGGGGACUGGGUGGGAAGCGUGCGUGACGGCUGUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))..)))))))).) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))..))))))))). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(..((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))..(.(((((((.((.......)).)))))))..........).)))))))))). |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((............))))........)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((((..(((....))).)))).....))))).))))))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((.((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))(((((((((((.((.(....))).))))))).....))))..))))))))))). |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((...[[[[[[...))))........))))))]]]]]].(((((((.............))))))).............))))))))). |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((...((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))). |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((.((((((((.((....((((..((....))..))))...))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))..))))))))). |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..((((((((.......((((............))))........)))))).)).......((((.[[[[[.......))))]]]]]..........)))))))))). |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))).))))))))))))((((((((.(((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))). |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((.((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((..(((..)))..))))[[[[[...))))))...(((((((.....(((((......]]]]])))))..)))))))..))))))))). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.((....((((..((....))..))))...))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))..))))))))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((.((((((((.((.(..((((............))))..)))...)))))).))((((((((....(((((.(((....))))))))).)))))))))))))))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((...........)))))..)))))))..))))))))). |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.((....((((..((....))..))))...))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))..))))))))). |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.((....((((..((....))..))))...))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((.((((((((.((....((((..((....))..))))...))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((((..(...((((((........))))))...)..).))))))..))...((((((.(...((...)).).)))))).....(((..))).)))))))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))..))))))).)))))))))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))((..(((.....(((((.(((....))))))))..)))..))..))))))))). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((((.......((((............))))........))))))...((((((......(((((...........))))).....)))))).)))))))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((((.......((((............))))........))))))...((((((......(((((..((....)).))))).....)))))).)))))))). |