|
|
|
GCCUACGGCCAUACCACGUAGAAUGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCUGCGUCGGGCGUGGUUAGUACUUGCAUGGGAGACCGGCUGGGAAUACCACGUGCUGUAGGCUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((.....(((((((...((..((((((......))..))))..))....))))))..)((.(((......((..(.(((....))))..)).....))).)))))........ |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((...........(((....))).........)))))))))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(..((((..((....))..))))..).....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((..((.((((..(((....)))..)))).)))))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...((((...........{{{{{{..(((((((...............[[[[))))))))))).......]]]].....}}}}}}.(((.....)))...))))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..)))...))))))...(((((((.....(((...(((....)))...)))...)))))))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.((((.((((....))))))))..)))))))).))))))))).. |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((......(((((........((((((..((((((((.................))))))))....................))))))...........))))))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))(((.((......((.((.(((....))))).)).....)).)))))))))..... |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((.(((.((((.bbbb(<<<<<<(([[[[[[[(..{{..{{{{{)))))))]]]]]]]aaaa}}a(}}})>>>>}}aa>>BBBB.)))..)AAAAA.)))))))))))AA |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((.(......)...))))..))....)))))).)))(((((......(((((..((....)).))))).....))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)).)..)))))).))(((((((.(.(....((.(((....))))).....)))))))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((......(((((........((((((....((((.......((((..((((((((...))))))))...))))...)))).....)))))).......))))))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....((((..............))))...)))))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..((.(....)).)..((((.(((((((((((((.((......)).)).)))))))...................)))))))).((((...))))..)))))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))...(((.(....((.((.(((....))))).)).)...)))...)))))))).). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))))))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....(..((.(((....)))))..)....)))))))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...((((((.(((((......)))))..........(((..((......))..))).)))))).....(((((..((....)).)).)))..........))))))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..........(((......[[[[)))....(((..]]]]......{{{{{{{)))..}}}}}}}....(((((..((....)).)).)))..........))))))))).. |