|
|
|
GUCUACGGCCAUACCUAGGCGAAAACACCAGUUCCCGUCCGAUCACUGCAGUUAAGCGUCUGAGGGCCUCGUUAGUACUAUGGUUGGAGACAACAUGGGAAUCCGGGGUGCUGUAGGCU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))).) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((....((((((((..(((..((((...(....)...))))..)))...)))))).))((((((......((((..(((....))).)))).....))))))))))...... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...................................))))))...((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.........[[[[[[[[..................))))))...((((((...........((((....))))]]]]]]]].))))))))))))))). |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))). |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((.((((((((((((((..))))))))))))))..)))))).)))((((((.((((((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))). |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.((((.((((....))))))))..)))))))).))))))))). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))). |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....))))).))).(((((......((((.((((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...((((((((..........[[[[[[[[[[[[[[[.........[[[[.......))))]]]].......]]]]]]]].......]]]]]]]...))))))))))))). |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....))))).))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((.((.((......))...))...))....)))))).))(((((.......((.((.(((....))))).))......)))))))))))))). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((...........((((....)))).........))))))))))))))). |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((............(((....)))..........))))))))))))))). |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))). |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..(((((((((.(((.((((((((......))))))).)))).).))))).))).(((((.....((((((.((((..))))))))))....))))))))))))))). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).))((((((...(..(((((.(((....))))))))...).))))))))))))))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((.....)))))))............((((.........[[[[[[[..((((...........))))....(((((.(((....))))))))......)))).]]]]]]]... |