|
|
|
GUCUACGGCCAUACCUAGGCGAAAACACCAGUUCCCGUCCGAUCACUGCAGUUAAGCGUCUGAGGGCCUCGUUAGUACUAUGGUUGGAGACAACAUGGGAAUCCGGGGUGCUGUAGGCU |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))).) |
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((....((((((((..(((..((((...(....)...))))..)))...)))))).))((((((......((((..(((....))).)))).....))))))))))...... |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...................................))))))...((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))))). |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.........[[[[[[[[..................))))))...((((((...........((((....))))]]]]]]]].))))))))))))))). |
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))). |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((((.((((((((((((((..))))))))))))))..)))))).)))((((((.((((((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))). |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).)..((((((..((.((((.((((....))))))))..)))))))).))))))))). |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((..((....))..))))..)))...)))))).))(((((((..((.(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))). |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....))))).))).(((((......((((.((((....)))))))).....))))).))))))))). |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...((((((((..........[[[[[[[[[[[[[[[.........[[[[.......))))]]]].......]]]]]]]].......]]]]]]]...))))))))))))). |
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....))))).))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((.((.((......))...))...))....)))))).))(((((.......((.((.(((....))))).))......)))))))))))))). |
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))). |
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))). |
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).)))(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((...........((((....)))).........))))))))))))))). |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((............(((....)))..........))))))))))))))). |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((((......))..))))..))....)))))).))((((((......((.((.(((....))))).)).....))))))))))))))). |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).))).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......((((.((((....)))))))).....))))))))))))))). |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..(((((((((.(((.((((((((......))))))).)))).).))))).))).(((((.....((((((.((((..))))))))))....))))))))))))))). |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).))((((((...(..(((((.(((....))))))))...).))))))))))))))). |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((............))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...))))).)))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))). |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((.....)))))))............((((.........[[[[[[[..((((...........))))....(((((.(((....))))))))......)))).]]]]]]]... |