|
|
|
GGAUGCGAUCAUACCAGCACUAAGGCAUCGGAUCCCGUCAGAACUCCGAAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACAAGGAUGGGUGACCUCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUUCCC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....)))).)))(((((..(....(((((..((....)))))))....)..))))))))))))..)) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............(((((((...(((..((((............))))..)))....))))).))...............(((.((....)))))......................... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((.......(((((((......))..)))))........))))).))(((((.......(((((..((....))))))).......)))))))))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((.......(((((............)))))........)))))...(((((..................................)))))))))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....(((((..((....)).)))))....)))))))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((...(....)...))))).)))....))))).))(((((.......(((((..((....))))))).......)))))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((..((((............))))..)))....))))).))(((((.(.....(.((((.((....)))))).).....))))))))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((............))))).)))....))))).)).((((..........((..((....))..))........)))).))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.((((((..(....))..))))).)))....))))).))(((((.((....(((((..((....)))))))....)).)))))))))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((.......(((((.[[[[[[.....)))))........]]]]]....{{{{{{.........])))))....}}}}}}............))))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))(((((.......((((((.((....))))))))......)))))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((...(((.[[[[[....))).....]]]]]........)))))....((((((.......[[[[[.......))))))....]]]]]...))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....)))).))).((((.......(((((..((....))))))).......)))).))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....)))).)))(((((..(....(((((..((....)))))))....)..)))))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((............))))).)))....))))).))(((((.......(((((..((....))))))).......)))))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).)..(((((((....((((((.((....))))))))...))))))).))))))).)). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((.......((((((.((....))))))))......)))))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....))))).)).((((.......(((((..((....))))))).......)))).))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((.......(((((............)))))........)))))...(((((.......(((((..........))))).......)))))))))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((............))))).)))....))))).))((((((......(((((..((....))))))).....)).))))))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))...................((....)).................))))))).)). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....)))))))).)...))))))))))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((......((((((((......))..))))..)).....))))).))(((((((.....((((((.((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..))))))))))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((......((((((((......))..))))..)).....))))).))(((((((.....((((((.((....))))))))....)))))))))))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((......((((((.(......)...))))..)).....))))).)).((((((.....(..((..((....)).))...)...)))))).))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....))))).))(((((.......(((((..((....))))))).......)))))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(..(((((((...(((.(((((............))))).)))....))))).)).(((((......(((((..........))))).....).)))))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..........((((((........((((((..((((....))))....(((((...........)))))...)))))).....))))))...........))))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((........((((............)))).........)))))...(((((.........(((...........)))........)))))))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((((......))..))))..)).....))))).))...................((....)).................))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....)))).)))(((((..(....(((((..((....)))))))....)..)))))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....)))).))).((((.......(((((..((....))))))).......)))).)))))).))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((((......))..))))).)))....))))).))(((((..(....(((((..((....)))))))....)..)))))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........)))))..((((...((((((.((((..((..((((...)).)).(((((..((..)).....)))))))...))))(((..)))))))))....)))).....)) |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((..((((............))))..)).....))))).))...((..(....(.(.(...((...)).).).).)....))...))))))).)). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((.(((((............))))).)))....))))).))(((((.......((((...((....)).)))).......)))))))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((...(((..((((((......))..))))..)))....))))).)).((((.........((((.((....))))))........)))).))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(((((((....((.(((((((......))..))))).)).....)))).)))(((((..(....(((((..((....)))))))....)..)))))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..................)))))......((((...(((....))).(((....))).)))).((((.......(((.((....))))).(((.....))).......)))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..................)))))......((((...(((....))).(((....))).)))).((((.......(((.((....))))).(((.....))).......)))).. |