CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - NDB_00048



RNA: NDB_00048
Rfam family: -

GCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGCGCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGC
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((())))))))))))))))))))))))))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..)))))))))))))(((((((((((((..)))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))))))))).(((((((((((....))))))))))).