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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - NDB_00051



RNA: NDB_00051
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((......(((((.......))))).))))((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.................(((((((.....)))).)))...(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(((....(((((((.....)))).))))))(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........[[[[.......(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))]]]]
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........)))).(((((.......))))).....((((......)))).))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((....(((((((.....)))).)))))))((((......)))).))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))..))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((................(((((((.....)))).)))....((((......)))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.........))))...(((((((.....)))).)))((.(((((.......))))))).))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((...[[[[.)))(((((((.....)))).)))]]]]((((......)))).))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..................(((((.......))))).....((((......)))).))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.................(((((((.....)))).)))...(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((....(((((((.....)))).)))))))((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....))((((((...))...((..)).....))))...((((((.....)))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((................(((((((.....)))).)))....((((......)))).))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((....(((((((.....)))).)))))))((((......)))).))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....