RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00004

RNA: PDB_00004
Rfam family: -

			GGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGCC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....(((((((.....)))))))....)).))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((((((...)))))))).......))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((((((...)))))))).......))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((((((...)))))))).......))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....))(((((.....)))))((....)).))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((((((...)))))))).......))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((((((...)))))))).......))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((((((...)))))))).......))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(((((((((...)))))))))..))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....((((((((...))))))))....)).))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((....(..(((((...)))))..)....)).))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((........(((..((.....))..)))......))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......(((((((.....))))))).......))))

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