|
|
|
GCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGC |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((((()))).))).))))).(((.((((((()))).)))..))).(((((((((((()))).))).)))))((((.((((((()))).)))..))))
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((..(((.....))).....)))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((((((.((.(.((((((((.(((((((((((.((.(.((....)).))))))))))).)).).)))))))).))))))))))).)).).)))) |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((.(.((((((((..((((((((((..................)))))))).))...)))))))).))))))))))).))...)))) |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((((((.((.(.((((((((.(((((((((((.((.(.(((()))).))))))))))).)).).)))))))).))))))))))).)).).)))) |
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....((((((((......[[[[[[[[....))))))))......]]]]]]]]....{{{{{{{{......))))((((....}}}}}}}}......)))) |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....((((((((......((((((((....((((((((.((((.....))))....))))))))......))))))))....))))))))......)))) |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.(((.......)))....)))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((.(.((((((..))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))).).))))))) |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....((((((((......((((((((....(((((((.........((((...)))))))))))......))))))))....))))))))......)))) |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((((.....))))....)))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((((((.((.(.((((((((.(((((((((((.((.(..........))))))))))).)).).)))))))).))))))))))).)).).)))) |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....((((((((......((((((((....((((((((.((((.....))))....))))))))......))))))))....))))))))......)))) |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((((.....))))....)))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((((.....))))....)))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((((.....))))....)))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((((((.((.((((((((((.(((((((((((.((.(((((..))))))))))))))).)))..)))))))))))))))))))).)))..)))) |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..((((((((((.((...((((((((..((((((((((.((...((....))..)))))))))).))...))))))))..)))))))))).))...)))) |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((....))))....((((.((((.((((....))))..((((.....)))).)))).((((((.((((.....))))....)))))).....))))... |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....)))).......[[[[[[[[(((....)))....))).]]]]]]]](((....))).....((((......((((....))))....))))... |