RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00072

RNA: PDB_00072
Rfam family: -

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))..(((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))..(((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))(((......)))............)))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))(((......)))............)))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))...)))))))))...((((((.....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))...)))))))))...((((((.....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))...)))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).(((((((((((((((.......))))))...)))))))))...)))))).....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).(((((((((((((((.......))))))...)))))))))...)))))).....))))))))))))))))))))))))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))))))))))).......((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))(.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..(((((((((.........((((.....)))))))))))))......))))))).))))))))))))))))))))))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((......((........))....)))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((......((........))....)))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))))))))))).......((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))(.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..(((((((((.........((((.....)))))))))))))......))))))).))))))))))))))))))))))))))))))
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))....................((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...{{{{)))))}}}})))))))))...((((((.....))))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...<<<<)))))>>>>)))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((.(((((((((.(((((...[[[[)))))]]]])))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).(((((((((.........((((.....)))))))))))))....................))))))))))))))))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((((((.....(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((((((.....(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........)))))))).....)))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........)))))))).....)))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((...((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((...((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))...((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))...((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...<<<<)))))>>>>............((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...aaaa)))))AAAA)))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).(((((((((.(((((...bbbb)))))BBBB)))))))))...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...[[[[)))))]]]])))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...........(((((...{{{{)))))}}}})))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.....)))).(((((((((...((((((...)))))).((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.....)))).(((((((((...((((((...)))))).((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.........((((.....)))))))))))))....((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))((((.....)))).))))))))....((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))((((.....)))).))))))))....((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((....(((((.....)))))..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))).(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))).........((((.....)))))))))))))....(((((.....))))).))))))))))))))))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))

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