RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00104

RNA: PDB_00104
Rfam family: -

			GUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCAC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((.((((())).)))))(((.((((())).)))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((..........)))))))))))..
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((..........)))))))).))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.(((()))).)))))))).))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.[[[[[[[[.))))((((.]]]]]]]].))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((..........)))))))).))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((..........)))))))).))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((..)))))))))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((..........)))))))).))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.((((((((.(((....).)))))))).)))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((..........)))))))).))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...((((((............))))))...)))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((..........)))))))).))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((..)))))))))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.((....)).)))))))).))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((..(....)..))))))))..)))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.((((((((.((.......)))))))).)))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((.((....)).))))))).)))))

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