CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00150



RNA: PDB_00150
Rfam family: -

GGAAGCAGGCUUCGGCCUUGUUUCC
Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((.((((..))))..))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....)))).))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....)))).))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....)))).))))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....)))).))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..))))).))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.......)))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....)))).))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.......)))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..((((....))))..)))).
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....)))).))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..)).)))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....))).)))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..((((....))))..)))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..((((....))))..)))).