CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00158



RNA: PDB_00158
Rfam family: -

GGGUGACGAUACUGUAGGCGAGAGCCUGCGGAAAAAUAGCCC
Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....(.((((((((....)))))))).).....))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(...(.((((((((....)))))))).)...).))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .(....)....((((((((....))))))))...........
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......((((((((....)))))))).....).))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........((((((((....))))))))...........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....(.(((((((((..)))))))).).)...)))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.......((((((((....)))))))).......))))