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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00175



RNA: PDB_00175
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] .(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.((((.((..(((.(((((...................................)..)))).))))).)))).))))....))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.(((((((...))))).))..((..((((((((..(((((.((......)))))))..)))))).))..))..))))....))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((.((((.(..((((.(((((.((((.((((.((.........)).)))).)))).)..)))).))))).)))).)))).)..))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.((((....((((.((((..((((.((((.((.........)).)))).))))....)))).))))..)))).))))....))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((....((((.((((..((((.((((...(((.((((.((.........)).)))).))).....)))).))))....)))).))))..))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((.((((.(..((((.(((((.((((.((((.((..((...)))).)))).)))).)..)))).))))).)))).)))).)..))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.......((((.....[[[[[[....))))...]]]]]].((((((...........)))))).((((((...........))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((....[[[[...((((((.((((((...........)))))).)))))).))).....]]]].(((.((((((...........)))))).)))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((......)))))(((.((((((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))))))).)))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((......)))))(((.((((((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))))))).)))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.((((.....(((.(((...((((.((((...............)))).)))).....))).)))...)))).))))....))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((.(((..)))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))..))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((......)))))(((.((((((.((......((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))......)))))))).)))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((....((((.((((((.((((((...........)))))).))))))...........))))...((((((...........))))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((......))((((((.((((((.((......)))))))).)))))).((......)))))(((.((((((.((......)))))))).)))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((......)))))(((.((((((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))))))).)))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................((((((.((......((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))......))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((...........((((((.((((((...........)))))).)))))).)))..........(((.((((((...........)))))).)))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((....((((.((((..((((.((((....((((.((((...............)))).))))..)))).))))....)))).))))..))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))))(((.((((((.((......)))))))).)))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))).(((.((((((.((......)))))))).)))
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................................................................................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))))(((.((((((.((......)))))))).)))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((...((((.((((((..........)).)))).)))).....((((((.((......)))))))).((((((.((......)))))))).)))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.......{{{{{{..))))....}}.}}}}.((((((...[[[[[[.)).))))...]]]]]].((((((.((......))))))))....