 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00192
RNA: PDB_00192
Rfam family:
-
| GGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACC | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..)))))))))))) | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.(....)..))..(((((((((...((.(....)..)).)))))))))(((.....))).......))))) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((........(((((((((......((.......)))))))))))))).....))........))))) |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.....((.....((((((((((...((.........)).))))))))))...)).....)).....))))) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................((((((((((......(....).....)))))))))).................))))) |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................((((((((((.................)))))))))).................))))) |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((......((....(....((((((((((...((.....)).....))))))))))...........)...))))))) |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.....((.....((((((((((...(..(....)...).))))))))))...)).....)).....))))) |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................((((((((((.................)))))))))).................))))) |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.......(((.......[[[[[[[[[)))................]]]]]]]]].................))))) |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.....((.....((((((((((...((.....)).....))))))))))...)).....)).....))))) |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((......(....).....((((((((((......(....).....))))))))))......(....).....))))) |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................((((((((((.................)))))))))).................))))) |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((..)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.....((.....((((((((((.................))))))))))...)).....)).....))))) |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................((((((((((.................)))))))))).................))))) |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((.....)))....)))((((((((((((.((.....))))...))))))))))......(....).......... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.....((.....((((((((((...((.....)).....))))))))))...)).....)).....))))) |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((.....((((...((((((((((((.((.....))))...)))))))))))).)).....))))...))))) |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......................((((((((((.................))))))))))...................... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................((((((((((.................)))))))))).................))))) |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((......(....).....((((((((((......(....).....))))))))))......(....).....))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((.....((.....((((((((((...((.....)).....))))))))))...)).....))))...))))) |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((......(....).....((((((((((......(....).....))))))))))......(....).....))))) |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..(....(..(((.(..((((((((((..(..(((..))).)..))))))))))..)..)))..)...)..))))) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((......(....).....((((((((((......(....).....))))))))))......(....).....))))) |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((.....((.....((((((((((...((.....)).....))))))))))...)).....)).....))))) |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((.................))).((((((.................)))))).(((.................))).. |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.................))))).((((.................)))).(((((.................))))) |