RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00213

RNA: PDB_00213
Rfam family: Gammaretro_CES

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((((((..))))))))))))))....((((..(((.((((((((((..))))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..((((((....))))))..)))......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))))
CMfinder(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((..................)))).......((((((((((....))))))))))
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((..................)))).......((((((((((....))))))))))
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((....)))))).....))....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..((((((....))))))..)))..))..((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((....)))))).(((((.....))))).....(((((((((....)))))....))))..)))))((((((((((....))))))))))
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((.((.(.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
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MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((....)))))).....)).....(((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))..(((((((((....)))))))).)
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Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((..(((((....)))))...))))...((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....)))))).(((((.....))))).(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((..((((((....))))))..)))......((((.((.(.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
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PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((...((.(((((((((....)))))....)))))).))))..((((((((....))))))))..
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).(((.((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).[[[[[[[[)))...]]]]]]]].
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((......(((((((((....)))))....))))...))))((((((((((....))))))))))
RNASampler(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..........(((((....)))))...........)))).(((((((((....))))))))).
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((..........(((((....)))))...........))))..((((((((....))))))))..
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))....))))))))))).......(....)((((...))))
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))....((((((....))))))....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((((..))))))))))))).....((((..(((.((((.((((((.....)))))))))))))))))(((((((((((..)))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(...((((..((((......))))...)))).).((((.((...((((.((((....)))).....)))).))))))..((((((((....))))))))..
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(...((((..((((......))))...)))).).((((.((...((((.((((....)))).....)))).))))))..((((((((....))))))))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((..((((((....))))))..)))......((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..((((((....)))))).(((((.....))))).)))).((((.(((....))).(((.....))).))))..((((((((....))))))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((....))))))..((((.[[[.)))).....(((.]]].))).......(((.....)))))))).(((((((((....))))))))).

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