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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00278



RNA: PDB_00278
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.....(((......)))..))))..(((((((....(((((.......))))).((((((((.............))))........(((((((((......(((((((....)))))))((...(((..(((((((((....)))))..))))..)))...)).)))))))))..))))..)))))))((((.......)))).))))))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.........(((.........)))....(((((((.((.(((((.......)))))))................................(((((((((...((((((.........(((((.......)))))............))))))................)))))))))........)))))))((((.......)))))))))))).
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((........................................................................................................................................................(((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))..((((((.(...((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))).)))))).....................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.(.....).))))...(((((((.((.(((((.......)))))))(((((((.............))))......(.((((((((((..((((((.(((((((.(((((.......))))).))...).)))))))))).)..............))))))))).))))...)))))))((((.......)))))))))))).
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..........((((....[[[[[))))...]]]]].....((((.......))))(((((((((....(((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))))))))))).)))))))))..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......)))))))))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((...((((......)))))))....(((((((.((.(((((.......)))))))((((.((((((...((((......))))...)))).))))))....(((((((.(((((((..((((...(((..(((((((((....)))))..))))..)))...))))))).)))).))))))))))))))((((......)))).)))))))).
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.......(((........))).......(((((((....(((((.......)))))((((((((.....(((((((...((..........))[[[((((.......))))......(((((.......))))))))))))..))))))))....................]]]...........)))))))((((.......)))))))))))).
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...((((......))))))))...(((((((.((.(((((.......)))))))((((.(...............................)))))....(((((((.(((((((.((.......))..(((((((((....)))))..))))............))).)))).))))))))))))))((((......)))).)))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........((((((.....(((((.......)))))....(((((.......)))))((((((((....((((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))).))))))))........)))))).....(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((dddd((((..cccc))))ddddd(.<<<<<<<.<<<<<<<CCCC.))){{{{))))))))(((((bbbbbbbb(.(()DDDDDeeeeeeeeeeeee.ee(.aaaaaaa)))))..((((>>>>>>>))))))BBBBBBB.(((((((((.)BDDDD(((.)AA..AAAAAEEEE.EEEEEEE>>>>>>>}}}}.)))..EEEE.)))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...((((......)))))))))..(((((((....(((((.......))))).(((((..(((..((.((......)).)).))).((((((((((.(((((((.((((.((.(((((.......))))).....)).)))))))))))))..............)))))))).)))))..)))))))((((.......)))).))))))).
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...((((.(...)))))))))...(((((((.((.(((((.......)))))))..............((((......))))......((((((...(((.[[[[[[......((((({{{{{.{)))))[[[.((((....)))))))]]].....}}}.}}}.))))))...]]]]]].)))))))((((......)))).)))))))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.......((((......))))..((((.((((....))))((((......)))).(((((((((....((((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))).)))))))))..........))))....(((((.......))))).....((((......)))).)))))))).
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UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...((((......)))))))))..(((((((....(((((.......))))).(((((..(((..((.((......)).)).))).(((((((((((.((((((.((((.((.(((((.......))))).....)).)))))))))))))..............)))))))).)))))..)))))))((((.......)))).))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........((((......))))....(((.(((....))).((((.......)))).((((((.....)))))).))).((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))...(((((....)))))..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).))))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((....{{{..)))..((((}}}.))))((((.......)))).)))))))......(((......((((.[[[[[..)))).(((((.......))))).(((((((((.......)))))...(((((....)))))..((((........)))).(((((.......))))).))))((((.]]]]].))))..)))....