|
|
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCAUCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((....((((((((((((.....((((...(((((.......)))))(((((((....)))))))........))))....)))))))))))).....))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((....((((((((((((.....((((...(((((.......)))))(((((((....)))))))........))))....)))))))))))).....))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))............................................................................... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((......((((((((..............(((((.......)))))..(((((....)))))....................)))))))).......))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((....((((((((((((..((.((((...(((((.......)))))(((((((....)))))))........))))).).)))))))))))).....))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......))))((((((((....))))))))..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......)))))))))))).... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((((........)))).(((((.((.((.(((((.....((((......)))).((((((((....)))))))).((((........)))).))))).)).)).))))).....((((......)))).)))))))).... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((..(.(..((((((..((....((((....((((......)))).((((((((....)))))))).......))))..).)..))))))..))....))))....((((......)))).)))))))).... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((....((((((((((((.....((((...(((((.......)))))(((((((....)))))))........))))....)))))))))))).....))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((((..).))).(((((((.((((((...)..)))))))).)))))))))).)))))))))))))))))((((((((((..(...)))))))))))(((((...)..))))....)))).... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..................(((((.......(((((.....((((......)))).((((((((....))))))))..................))))).......))))).....((((......)))).)))))))).... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((((.....(((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....)))))))........)))))).....(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................(((((.((.((.(((((....(((((.......)))))(((((((....)))))))...................))))).)).)).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((((........)))).(((((.......(((((.....(((((...).)))).((((((((....)))))))).((((........)))).))))).......))))).....(((((...).)))).)))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..................(((((.......))))).....((((......)))).))))))))....((((((((..................(((((.......))))).....((((......)))).)))))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((((..(.(..((((((..((....((((...(((((.......)))))(((((((....)))))))........))))..).)..))))))..))....))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......(((((......(((((.((.((.(((((....(((((.......)))))(((((((....)))))))...................))))).)).)).))))).)))))(((.......))).)))))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((........((((......(((((.((.((.(((((.((((((((.......))))((((((((....))))))))........))))......))))).)).)).))))).))))((((.......)))))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....))(((.((.(.(((((.((((((........)).))))))))).)..((((((.(.(.((((...............))))))))).))).((..))....)))))...((((((.....))))))))))))).... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((..(.(..((((((..((....((((....((((......)))).((((((((....)))))))).......))))..).)..))))))..))....))))....((((......)))).)))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((..(.(..((((((..((....((((....((((......)))).((((((((....)))))))).......))))..).)..))))))..))....))))....((((......)))).)))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).((((((((.......)))).(((((((....))))))).........))))......(((((.......))))).....((((.......)))).))))))).... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))..((((([[[[)))))....((((..]]]]..)))).(((((.......))))).....((((.......)))).))))))).... |