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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00313



RNA: PDB_00313
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((.........))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...............(((((((((...)))))).)))..((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...(((((....)))))...))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(..............(((((((...)))))))...).((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))....(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((.............((((((((...))))))).).))((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))....((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((..[[[[[[.)))....]]]]]]....(((...[[[[)))...]]]]....))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((......)))...(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............((((.[[[[[)))).]]]]].....(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((((..))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.......(((........((((((............))))))........))).))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...(((((....)))))...))))....(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(.(((((((((.((((((..)))))))).))).))....(......)..)).)))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((................(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...(((((....)))))...))))....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((......))).....((((((.....)))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((...[[[))).....((((((]]]..)))))).....((((.......)))).)))))))....