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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00349



RNA: PDB_00349
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((.......((((.((((())))).......)))).)))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......((((.((..(((....))).)))))).)))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......((((.(((....))).......)))).)))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((.......)))))))(((((.((.......)))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((............)))))(((((............)))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((............)))))(((((............)))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((.......))))))).((((.((.......)))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..[[[(.{{{{.)))))(((((..)]]].}}}}.)))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......[[[[.)))))............]]]]......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..[[[(.{{{{.)))))(((((..)]]].}}}}.)))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..))))))))))((((((((((..))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......((((.((((..)))).......)))).)))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((({(([[[(.<<<<.))}))((((()>)>>>.]]]).)))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((............)))))(((((............)))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......[[[[.)))))............]]]]......
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((............)))))(((((............)))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((............)))))(((((............)))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((....))).)))))(((((.(((....))).)))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........)))))))(((((((........)))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((......)).)))))(((((.((......)).)))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......((((.((..(((....))).)))))).)))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((............)))....(((............)))..
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......[[[[.)))))............]]]]......