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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00358



RNA: PDB_00358
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((((.......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))((((.(((((...))))))))).(((((((((((.((((((((((....)))))..((((.........))))((((.(((((...))))))))).))))))))))).))))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......)))))......((((((((((.((((((((((....)))))....................(((((.......))))).....))))))))))).)))).)))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).........................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))((((((.......)))))...).(((((((((((.(((((((((((()))))))..((((.........))))((((((.......)))))...).))))))))))).))))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((............[[[[[)))....]]]]].....(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).))))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((.(((((...))))))))...((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).)))).)))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.((.((.(((((.....((((([[[[[[.)))))........((((....))))..............))))).)).)).))))).....(((((]]]]]].))))))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((....))))))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))(((((((((((..)))))))))..)))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.........))).((((.(((((...))))))))).(((((((((((.(((((.((.....((((....))))...))........((((.(((((...))))))))).))))))))))).))))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........(((((......(((((.......))))).))))).((((((((((((...((((((..)))))).........(((((......(((((.......))))).))))).))))))))))))...)))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((....)).))))((((.(((((...))))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).))))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((((((.((((((((.(((((...))))))))).(((((.......)))))(((((....)))))..)))))))))))).))))((((.(((((...))))))))).(((((.......))))))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........((........((((.((((.....))))))))))((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))).)))))))
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((.......)))).((((.(((((.(((((((((((.((((((...)..)))))((((..(..)))))...((((.......)))).)))).)))).)))))))))))).((((((...)..))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((.((((.....)))))))..(((((.......)))))(((((....)))))..((((.........)))).(((.((((.....)))))))..(((((.......))))))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((.((((.....)))))))..(((((.[[[[[.)))))((.....)).((((..((((.........)))).(((((.......)))))...))))(((]]]]]..)))..)))))))