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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((..(((((.......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........))))((((.(((((...))))))))).(((((((((((.((((((((((....)))))..((((.........))))((((.(((((...))))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....................(((((.......)))))......((((((((((.((((((((((....)))))....................(((((.......))))).....))))))))))).)))).))))))) |
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CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))......................................................................... |
|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........))))((((((.......)))))...).(((((((((((.(((((((((((()))))))..((((.........))))((((((.......)))))...).))))))))))).)))))))))))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.....(((............[[[[[)))....]]]]].....(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((.(((((...))))))))...((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).)))).))))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....................(((((.((.((.(((((.....((((([[[[[[.)))))........((((....))))..............))))).)).)).))))).....(((((]]]]]].)))))))))))) |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((....))))))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))(((((((((((..)))))))))..))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((.........))).((((.(((((...))))))))).(((((((((((.(((((.((.....((((....))))...))........((((.(((((...))))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.........(((((......(((((.......))))).))))).((((((((((((...((((((..)))))).........(((((......(((((.......))))).))))).))))))))))))...))))))) |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((((....)).))))((((.(((((...))))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((((((((((.((((((((.(((((...))))))))).(((((.......)))))(((((....)))))..)))))))))))).))))((((.(((((...))))))))).(((((.......)))))))))))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.........((........((((.((((.....))))))))))((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))).))))))) |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...............((...(((((.......)))))...))(((((((((((.((((((((.....((((....))))...)))...((...(((((.......)))))...))))))))))))).)))))))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...((((.......)))).((((.(((((.(((((((((((.((((((...)..)))))((((..(..)))))...((((.......)))).)))).)))).)))))))))))).((((((...)..)))))))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.((((.....)))))))).))))))))))).)))))))))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((.((((.....)))))))..(((((.......)))))(((((....)))))..((((.........)))).(((.((((.....)))))))..(((((.......)))))))))))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((.((((.....)))))))..(((((.[[[[[.)))))((.....)).((((..((((.........)))).(((((.......)))))...))))(((]]]]]..)))..))))))) |