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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00392



RNA: PDB_00392
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))...((((((.......)))).......((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((....))))))))....(((((..(((((...........)))))...((((....)))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))))(((((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))).....(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))).(...(((((.......)))))...).(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))))(((((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((....))))))))..(((((.......))))).....(((((.......)))))...........
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((....))))))).(((.[[[[[)))............(((((.......)))))......]]]]]
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((....))))))).((((.((((..(((((.((....))..))))).)).)).))))((....)).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((((....))))))).((((.((((..(((((.((....))..))))).))))..)))).))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))))...(((((....[[[))))).....(((((]]]....)))))..)))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))((((((((((...)..)))))))))(((((((...)..))))))))))))....
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)).)).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(.(((((((....)))))))...(((((.......))))).....(((((.......)))))...).......
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))))..(((((.......))))).....(((((.......)))))...))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((....))))))))..(((((.......))))).....(((((.......))))).((.....)).
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((((....))))))).((((.((((..(((((.((....))..))))).))))..)))).))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((....)))))))...(((((.......))))).....(((((.......)))))...........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((....))))))))....(((((..(((((...........)))))...((((....)))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((((....))))))).((((.((((..(((((.((....))..))))).))))..)))).))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((((....))))))).((((.((((..(((((.((....))..))))).))))..)))).))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))).((.(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))))..((((((((..)).))))))....(((((.((..))))))).)).)))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((((....))))))).((((...((..(((((...........))))).))....)))).))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))))...(((((.......))))).....(((((.......))))).))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))))..(((((....{{{))))).......(((}}}....)))[[[..))))]]].