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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00403



RNA: PDB_00403
Rfam family: -

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((........)))))(((((((((..(((.((.....(((((.(((((((.((((...(((((((.((((....))))((((....)))).....)))))))....)))).......(((.....(((((((((.......))))))))).)))...((((((((.(((((....)))))...)).(((....)))...))))))....((((((((((.......)))))))))).(((....)))((((.(...).))))....(((((.......)))))..............)))))..)))))))...........((((((((...((.......))...))))))))...............(((((((((((..((.((((((......))))))...))..((((.....))))......)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))).)))))))..))...
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........))))))((((((((......(((((((((............(((((.((((((((.(((((..)))))((((....)))).....))))))))..))))).....((((((.....((((((((.......)))))))))))))).((((((((..((((((..))))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....))))))))).............((((((.....))))))...(((((((..........(((..)))........))))))).))))...((((....((((((..(((((..)))))..(((((((((((((((((....(((((((......))))))).(((((((....)))))))......)))))....)))))))........))))).......)))))).)))).....))))))))......
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))..((((.((((((((.(((.((((.((((((((.(((((((((((((.((((((((.((((....))))((((....)))).....))))))))..))))).....((((((.....((((((((.......))))))))))))))......((((.(((((....)))))).))).(((....))).............(((((((((((.....)))))))))))((((....))))............(((((.((((((.....)))))))))))........)))))).)).)))))..............................(((((((((.(((....)))..)))..))))))..(((.((((((((((((......))))))).))))))))......((((........))))...........))).(((((((....))).))))...)))).))).)))))))).)))).
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))..((((.((((((((..((.(((.....(((((.((((((((.((((.((((((((..(((....))).((((....)))).....)))))))).....(((.(((.(((((.....((((((((.......)))))))))))))..((((((((..(((((....)))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....)))).))).)))....(((((.((((((.....)))))))))))..).))).)))))).)).))))).......((((.((((((((..(((((...(((((((((((((....))).))))..))))))..((((.(((((((((((......)))))).))))))))).))))).(((.....))).....))))).))).....(((((((....))).))))))))))).))..)))))))).)))).
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))..((((.((((((((((((.(((((...(((((.((((((((.(((((((((((((.((((....))))((((....)))).....)))))))).....(((((.(((((.(((..(((((((((.......)))))))))..))..((((((((..(((((....)))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....))))).))))))))))(((((.((((((.....))))))))))).)).))).)))))).)).)))))...........((((((((...((.......))...))))))))))))).))))((((.((((((((((((((((((((((......))))))).)))).((((.....))))......)))))....))))))(((...(((((((....))).)))).)))..))))..)))))))).)))).
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((..)))))))).((((((((.((((...(.(..((((((((((((((.(((((.((..(((((..(((((...(((((...).)))).(((((.((((((((....(..)(((((..((..(((((((((.......))))))))).((...))..))))))).(....))))))))))).)))...((((........))))..(((((((((.(......))))))))))(((((..)))))))))))))))))(((((.(((((((..)).)))))))))).)).))).)))))).))))))))((((((.((..(((((((((.(((......).))).))))))))..))...(..)((......))((((.(.(((((((((.(...)))))))).)).)))))..((((((((.(......)))..))))))))))....(((((((....))).)))).)).))..))))))))))))......
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))..((((.((((((((..((.(((.....(((((.((((((((.((...((((((((..(((....))).((((....)))).....)))))))).........(((..((((.....((((((((.......))))))))))))...((((((((..(((((....)))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....)))).)))........(((((.((((((.....))))))))))).....)).)))))).)).)))))...............(((((..((((.....((((((((.(((....)))..)))..)))))...(((..(((((((((((......))))))).)))).)))..)))).................))))).........(((((((....))).))))....))).))..)))))))).)))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))..((((.((((((((..(..(((.....(((((.(((((((((((((.((((((((..(((....))).((((....)))).....))))))))..)))))..(((.(((((.....((((((((.......)))))))))))))..((((((((..(((((....)))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....)))).)))........(((((.((((((.....)))))))))))........)))))).)).))))).......((((.((((((((..(((((...(((((((((((((....))).))))..))))))..((((.(((((((((((......)))))).))))))))).))))).(((.....))).....))))).))).....(((((((....))).)))))))))))..)..)))))))).)))).