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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00425



RNA: PDB_00425
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((..(((.........)))((((((((...))))))))....(((((.......))))))))))).....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...)))))..((..(((((.......)))))....))((((.......))))..))))).....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((....)))......(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...)))(((((((.(((((((..))))))))))))))(((((...)..))))))))))).....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...)))))).....(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))).....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))).....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.........)))...((((((..((..(((....)))..))..))))))..))))))).....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....))).......(((((.......)))))......((((.......)))).)))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....))).......(((((.......))))).((((..[[[...))))]]]..)))))).....