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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00433



RNA: PDB_00433
Rfam family: -

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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((.((((.......)))).((.((((((((..((((...(((((((((....)))..))..)))).....)).))..)).))))))))..........)))).)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((..((((.......))))..)))).......(((......)))..(((....)))((((..((((.......))))..)))).......(((......)))..)))).
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((..((((.......))))..))))...............................((((..((((.......))))..))))..........................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((.......))))..)))).......(((......(((..(((....)))((((..((((.......))))..)))).......)))......)))..)))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((.......))))..)))).......(((......)))..((((()))))((((..((((.......))))..)))).......(((......)))..)))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......((((.......)))).............(((......)))..)))))(((((......((((.......)))).............(((......)))..)))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((....)))...)))).[[[[[[...(((......)))..))))).....((((...(((....)))...)))).]]]]]]...(((......))).......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((......((..(((......)))..))........))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((.......))))..)))).......(((......)))..)))))(((((((((..((((.......))))..)))).......(((......)))..)))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..))))))))))))(((((((((((((....)))))))(((..)))((((((((((((..))))))))))))))))))(((((((....)))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((...(((....(((...((((.......(..(((......)))..).........))))...)))....)))...))))..........(((......)))..)))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((........((((..........(((......)))..((((..))))))))))))))))........))))..........(((......)))..)))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......((((.......)))).....................((((.....((((..(((((..((((.......))))..))))).......))))...))))..)))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((.......))))..))).((((........))))....(((((..)))))(((..((((.......))))..))).((((........))))....))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((..((((...((((..........(((......)))..(((....)))))))...))))..))))...))))..........(((......)))..)))))
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((((.......))))..............(((.....(((.(([[[[[[......)).))).((((....]].]]]])))).......)))......)).)))))