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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00475



RNA: PDB_00475
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((................(((..(((((.....)))))...)))(((((.......))))))))))))....(((((((...............(((((.....))))).......................)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....((((........(((((.......)))))...((((((..((((....((((((((((....)))))))))).....))))..(((((.......)))))...))))))..))))....))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...............(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))((((((((....)))))))).............(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...............(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))))))))))...........................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((((............(((((.......))))).....(((((.......)))))(((((((....)))))))....))))......(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.........))..(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))((((((((....)))))))).........(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.........(((.....[[[[))).......]]]](((....((((.......))))((((((((....)))))))).(((.....))).[[[[[)))....]]]]]......((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.....))))).(((.(((((.......)))))..))).((((......))))(((((((((....)))))))))(((.....))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..............(((.((((((.((.(.(((((..(((.((((......))))(((((((((....)))))))))........))).)))))).)).).)))))..))).((((......)))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...................(((((.......)))))......((((.......))))((((((((....))))))))..........((.(((((.......)))))..))..((((.......))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.............(((.(((((.......)))))..)))..(((......)))((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..)))..((........))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.....((((.....(((((.......)))))((((((((((.......)))))(((((((....))))))).)))))...)))).(((((.......))))))))))(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.............(((.(((((.......)))))..))).(((.((.((.(((((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..))).))).)).)).)))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.............(((.(((((.......)))))..)))..((((....))))((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..)))..((((....))))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....((((........(((((.......)))))...((((((..((((....((((((((((....)))))))))).....))))..(((((.......)))))...))))))..))))....))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.......((.(.(((..((((((....).)))))...((((((..((((.(..((((((((((....))))))))))...).))))..((((((....).)))))...))))))..))).).))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.....)))))))...(((((.......))))).))))).((((((......((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..)))(((((.......))))).))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.((.....((((.....((((((....).))))).((.((((((.......))))((((((((....)))))))))).))...)))).((((((....).))))).)).))((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(...((((((..)))((((((((....)))..)))))(((((((((((....((((((((((....)))))))))).....)))).)))(((((........)).)))))))....)))...)))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....................................................((((((((((....))))))))))...............................................))))))))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((...(((......))).(((((.......)))))......((((.......)))).(((((((....))))))).(((((........(((((.......))))).....(((((.......))))).))))).))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..[[[)))).(((...]]]))).(((((.......)))))......((((.......)))).(((((((....))))))).(((..........(((((.......))))).(((((((((.......))))..))))).))).