|
|
|
GGGCCCGUGGUCUAGUUGGUCAUGACGCCGCCCUUACGAGGCGGAGGUCCGGGGUUCAAGUCCCCGCGGGCCCACCAGGGCCCGUGGUCUAGUUGACGCCGCCCUUACGAGGCGGAGGUCCGGGGUUCAAGUCCCCGCGGGCCCACCA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((................(((..(((((.....)))))...)))(((((.......))))))))))))....(((((((...............(((((.....))))).......................)))))))....
|
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....((((........(((((.......)))))...((((((..((((....((((((((((....)))))))))).....))))..(((((.......)))))...))))))..))))....)))))))))).... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...............(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))((((((((....)))))))).............(((((.......)))))......((((.......)))))))))))).... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...............(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))))))))))........................................................................... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....((((............(((((.......))))).....(((((.......)))))(((((((....)))))))....))))......(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.........))..(((.(((((.......)))))..))).((((.......))))((((((((....)))))))).........(((.(((((.......)))))..))).((((.......)))))))))))).... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.........(((.....[[[[))).......]]]](((....((((.......))))((((((((....)))))))).(((.....))).[[[[[)))....]]]]]......((((.......)))))))))))).... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.....))))).(((.(((((.......)))))..))).((((......))))(((((((((....)))))))))(((.....))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..............(((.((((((.((.(.(((((..(((.((((......))))(((((((((....)))))))))........))).)))))).)).).)))))..))).((((......))))))))))))).... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...................(((((.......)))))......((((.......))))((((((((....))))))))..........((.(((((.......)))))..))..((((.......)))))))))))).... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.............(((.(((((.......)))))..)))..(((......)))((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..)))..((........)))))))))))).... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((.....((((.....(((((.......)))))((((((((((.......)))))(((((((....))))))).)))))...)))).(((((.......))))))))))(((((.......)))))))))))).... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.............(((.(((((.......)))))..))).(((.((.((.(((((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..))).))).)).)).))))))))))))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.............(((.(((((.......)))))..)))..((((....))))((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..)))..((((....)))))))))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....((((........(((((.......)))))...((((((..((((....((((((((((....)))))))))).....))))..(((((.......)))))...))))))..))))....)))))))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.......((.(.(((..((((((....).)))))...((((((..((((.(..((((((((((....))))))))))...).))))..((((((....).)))))...))))))..))).).)))))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.....)))))))...(((((.......))))).))))).((((((......((((((((((....)))))))))).......(((.(((((.......)))))..)))(((((.......))))).)))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.((.....((((.....((((((....).))))).((.((((((.......))))((((((((....)))))))))).))...)))).((((((....).))))).)).))((((.......)))))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.(...((((((..)))((((((((....)))..)))))(((((((((((....((((((((((....)))))))))).....)))).)))(((((........)).)))))))....)))...))))))))))).... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....................................................((((((((((....))))))))))...............................................)))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..............(((.(((((.......(((((..(((.((((......))))(((((((((....)))))))))........))).))))).......)))))..))).((((......))))))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((...(((......))).(((((.......)))))......((((.......)))).(((((((....))))))).(((((........(((((.......))))).....(((((.......))))).))))).))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((..[[[)))).(((...]]]))).(((((.......)))))......((((.......)))).(((((((....))))))).(((..........(((((.......))))).(((((((((.......))))..))))).))). |