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GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUC |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((......)))))).(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....))))))) |
|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((......(((.((......((....))..)).))).....)))).))))))).)..))))))) |
|
CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((...(..(((.(((.....((....))).)).)))....))))).))))))).)..))))))) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((..[[[[)))))).(((((....)))))..................]]]].))))))).....)))))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))(((......)))....(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....))))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))..................((((....(((....)))....)))).........)))))))....))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))(((......)))....(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....))))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((......)))))).((((((..))))))....((((..........)))).)))))))....))))))) |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))(((......)))....(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....))))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((......)))))).(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....))))))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))).....))))))) |
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..(((((.((((((((((..(((((......)))))..)))))))))).((..))((((((..))(((((..))))).((((.(........))))).)))))))))..).)))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...((((((((((..(((((..((((((....))))))..)))))..))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((..((((.....))))..((((((....))))))(((....))).((((......))))...(((((....))))).....)))).(((((............)))))..))))))) |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((..((((.....))))..((((((....))))))(((....))).((((......))))...(((((....)))))..[[[)))).(((((.......]]]..)))))......... |