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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00569



RNA: PDB_00569
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))))).....((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))).....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........(((..((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((.((((((((((....))))))))........)))))))))))..))))..))))))...))))..))))))...)))..))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..........(((((((((..((((..((((((...((((..((((((........((((((((....)))))))).............))))))..))))..))))))...))))..))))))..)))...))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((........))))..((((.......))))..............................................................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((..(((((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((((.((((((((....)))))))).).....)..)))))))))..))))..))))))...))))..))))))..))))).))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((...))).(((((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((...((((((((....))))))))(((...))).)))))))))..))))..))))))...))))..))))))..)))...))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.((((((.(((((..((((((...((((.(((((((..(((((.((((((((....)))))).....)).).)))).))))).))))))..))))))...))).))))))))..))))..))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(......((((.((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((((.((((((((....)))))))).)......)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))..))))).))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((([[......)))).(((((]].....)))))......((((..<<...)))).(((((((....)))))))..(((({{......)))).(((((}}.....))))).......(((..>>...)))..)))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(.((((.((((((.(((((..((((((...((((.(((((((..(((((.((((((((....))))))))......).)))).)))))).)))))..))))))...)))).)))))))..))))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((((......(((((.......))))).....(((((.......)))))(((((((....)))))))...))))))))))......(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((....))).((((((..((((..((((((...((((..((((((........((((((((....))))))))..(((....))).))))))..))))..))))))...))))..))))))........))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(.((((.((((((.(((((..((((((...((((.(((((((..(((((.((((((((....))))))))......).)))).)))))).)))))..))))))...)))).)))))))..))))).))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.((((((..((((..((((((...((((..((((((..((((..((((((((....))))))))........)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))..))))..))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(......((((.((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((((.((((((((....)))))))).)......)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))..))))).))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((...)).(((.((((((..((((..((((((...((((..((((((........((((((((....))))))))..(((....))).))))))..))))..))))))...))))..))))))..)))...))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(......((((.((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((((.((((((((....)))))))).)......)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))..))))).))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))((((((...(((.((((((....((((((...)..)))))(((((((....)))))))..((((........)))))))))))))....))))))....((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.((((((..((((..((((((...((((..((((((..((((..((((((((....))))))))........)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))..))))..))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((....))).((((((..((((..((((((...((((..((((((........((((((((....))))))))..(((....))).))))))..))))..))))))...))))..))))))........))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..((((........)))).(((((.......))))).))))).(((.......))).((((((((....)))))))).((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))...........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..((((........)))).(((((.......))))).))))).((((((........))).((((....)))).....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))....)))....